More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0810 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0810  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1181  ABC transporter related  80.79 
 
 		 234 aa  378  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0796  ABC transporter related protein  49.56 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3458  ABC transporter, ATP-binding protein  51.64 
 
 		 236 aa  221  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.572348  normal  0.0203751 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0897  ABC transporter related protein  48.43 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0474  ABC transporter related  43.3 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0602  ABC transporter related  42.33 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1376  ABC transporter related  46.15 
 
 		 243 aa  198  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000264902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18110  ABC transporter related  44.39 
 
 		 241 aa  197  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464021  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1310  ABC transporter related  45.67 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260124  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0337  FeS assembly ATPase SufC  38.6 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0664  ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0666  FeS assembly ATPase SufC  34.67 
 
 		 246 aa  144  9e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1561  ABC transporter-related protein  36.4 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  33.91 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1216  ABC transporter related  36.97 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000901825  normal  0.0692557 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  36.82 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  36.82 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  39.15 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1165  ABC transporter related  36.14 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  36.55 
 
 		 262 aa  138  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3013  ABC transporter related  32.29 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0529408  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  39.91 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  39.55 
 
 		 255 aa  134  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  35 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  37.23 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  33.47 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2389  FeS assembly ATPase SufC  36.71 
 
 		 281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  37.95 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  37.95 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  34.36 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  34.72 
 
 		 257 aa  131  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  35.44 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  35.19 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0516  FeS assembly ATPase SufC  31.2 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  35.24 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  33.92 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  36.94 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  37.61 
 
 		 321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  33.47 
 
 		 260 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  34.18 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  34.18 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  32.9 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  36.84 
 
 		 247 aa  128  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  34.75 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  32.89 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  36.17 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  33.48 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  36.44 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  35.53 
 
 		 310 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  39.15 
 
 		 249 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  35.32 
 
 		 259 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1205  ABC transporter related  39.59 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0586887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  29.49 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  35.29 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  33.89 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  30.57 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1259  FeS assembly ATPase SufC  33.76 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000235228  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  34.6 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0405  FeS assembly ATPase SufC  36.44 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.300963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  36.13 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  33.48 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  35.22 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00831  ABC transporter, ATP binding component  31.93 
 
 		 261 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  33.19 
 
 		 248 aa  124  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  38.86 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  32.5 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  37 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00801  ABC transporter, ATP binding component  32.9 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.681309 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  34.91 
 
 		 261 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  33.18 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  35.21 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  35.44 
 
 		 261 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00841  ABC transporter, ATP binding component  32.34 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.520041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  34.89 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  35.44 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  35.44 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  35.44 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  35.44 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  35.44 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  35.44 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  34.89 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  35.65 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 277 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  38.39 
 
 		 288 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  33.77 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  33.48 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  34.25 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  37.26 
 
 		 311 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.74 
 
 		 336 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  35.44 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0594  ABC transporter related  28.89 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  37.38 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  35.44 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  35.62 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  35.32 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>