More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1181 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1181  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0810  ABC transporter related  80.79 
 
 		 230 aa  378  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0796  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3458  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.572348  normal  0.0203751 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0897  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0602  ABC transporter related  41.96 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1376  ABC transporter related  46.43 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000264902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0474  ABC transporter related  44.98 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1310  ABC transporter related  45.98 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18110  ABC transporter related  45.13 
 
 		 241 aa  205  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464021  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0337  FeS assembly ATPase SufC  38.2 
 
 		 252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1561  ABC transporter-related protein  36.25 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  37.72 
 
 		 245 aa  144  9e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1216  ABC transporter related  37.85 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000901825  normal  0.0692557 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3013  ABC transporter related  35.19 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0529408  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1165  ABC transporter related  36.14 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  37.67 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0666  FeS assembly ATPase SufC  33.77 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  37.67 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  36.75 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  34.65 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 		 245 aa  136  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  34.89 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  35.74 
 
 		 262 aa  135  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  34.73 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  34.58 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  37.05 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  32.77 
 
 		 271 aa  131  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  33.9 
 
 		 256 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  33.9 
 
 		 256 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  39.57 
 
 		 267 aa  131  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  33.62 
 
 		 240 aa  131  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  37.1 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  37.1 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2389  FeS assembly ATPase SufC  34.84 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  34.76 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  36.24 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0664  ABC transporter ATP-binding protein  34.22 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  34.03 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  37.22 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  35.02 
 
 		 262 aa  129  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  35.9 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  33.48 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  32.75 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0405  FeS assembly ATPase SufC  35.15 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.300963  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  34.17 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  35.59 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0516  FeS assembly ATPase SufC  31.4 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  33.9 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  30.17 
 
 		 248 aa  128  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  36.98 
 
 		 258 aa  128  6e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  35.29 
 
 		 241 aa  128  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  33.19 
 
 		 253 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00801  ABC transporter, ATP binding component  33.33 
 
 		 257 aa  128  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.681309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  38.91 
 
 		 321 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  35.37 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  38.57 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  39.15 
 
 		 271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3307  FeS assembly ATPase SufC  35.9 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000620228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  34.75 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 		 256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  33.04 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00811  ABC transporter, ATP binding component  33.9 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  36.07 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  37.07 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  33.48 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  33.92 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  34.75 
 
 		 257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  35 
 
 		 252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0679  ABC transporter related  35.74 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  33.64 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  33.63 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  34.75 
 
 		 241 aa  125  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  34.29 
 
 		 266 aa  125  8.000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  37.39 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  36.49 
 
 		 265 aa  124  9e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  33.61 
 
 		 259 aa  124  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 		 250 aa  124  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  34.33 
 
 		 250 aa  124  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  38.03 
 
 		 246 aa  124  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  33.33 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  34.18 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  34.6 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  34.18 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0566  FeS assembly ATPase SufC  35.98 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  34.03 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  36.13 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  34.18 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0051  FeS assembly ATPase SufC  33.63 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0644623  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26780  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  35.65 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  36.28 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1137  FeS assembly ATPase SufC  38.3 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.324053  normal  0.0277832 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  33.62 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1259  FeS assembly ATPase SufC  33.05 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000235228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  35.17 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  32.63 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  33.33 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>