More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1561 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1561  ABC transporter-related protein  100 
 
 
245 aa  498  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3013  ABC transporter related  54.63 
 
 
240 aa  248  7e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0529408  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1216  ABC transporter related  53.42 
 
 
258 aa  235  6e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000901825  normal  0.0692557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0664  ABC transporter ATP-binding protein  42 
 
 
248 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1165  ABC transporter related  41.82 
 
 
254 aa  203  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1310  ABC transporter related  38.72 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260124  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1376  ABC transporter related  38.72 
 
 
243 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000264902  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0897  ABC transporter related protein  35.55 
 
 
228 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1181  ABC transporter related  36.25 
 
 
234 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0796  ABC transporter related protein  40.1 
 
 
252 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3458  ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 
236 aa  142  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.572348  normal  0.0203751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0810  ABC transporter related  36.4 
 
 
230 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371483  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0474  ABC transporter related  37.5 
 
 
243 aa  142  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18110  ABC transporter related  36.49 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464021  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0602  ABC transporter related  37.21 
 
 
247 aa  139  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  33.73 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  34.27 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0037  ABC transporter related  37.06 
 
 
228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  33.75 
 
 
252 aa  125  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  33.65 
 
 
251 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  34.87 
 
 
262 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  32.37 
 
 
251 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  36.06 
 
 
246 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  33.17 
 
 
251 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1086  ABC transporter related  36.55 
 
 
228 aa  122  7e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.48609  normal  0.328712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  33.33 
 
 
255 aa  121  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  33.74 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  32.38 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  37.5 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1972  ABC transporter related  33.05 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.161384  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0952  ABC transporter related  36.96 
 
 
228 aa  116  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000909223  hitchhiker  0.000313901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  33.48 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  31.6 
 
 
249 aa  115  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  31.08 
 
 
248 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  33.02 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  32.86 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  33.64 
 
 
264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  33.67 
 
 
243 aa  113  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  33.89 
 
 
251 aa  113  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0516  FeS assembly ATPase SufC  31.22 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  30.36 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  28.37 
 
 
246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  30 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  35.56 
 
 
253 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.26 
 
 
354 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  29.77 
 
 
250 aa  111  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  32.63 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  31.28 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  31.28 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2129  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.67 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  34.45 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.93 
 
 
376 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.63 
 
 
346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  32.26 
 
 
338 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  27.83 
 
 
245 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  30.97 
 
 
249 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  33.48 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  32.79 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  32.44 
 
 
255 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  32.26 
 
 
357 aa  109  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  30.84 
 
 
251 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  29.96 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  29.2 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  29.2 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  29.2 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
354 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  28.97 
 
 
248 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  31.56 
 
 
252 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  30.53 
 
 
250 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  30.1 
 
 
310 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  30.53 
 
 
251 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  36.63 
 
 
253 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  30.53 
 
 
250 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  30.4 
 
 
251 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  35.96 
 
 
264 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.91 
 
 
374 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  33.65 
 
 
256 aa  106  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.9 
 
 
336 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  31.42 
 
 
249 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  28.17 
 
 
248 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  30.8 
 
 
256 aa  106  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  28.76 
 
 
250 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  31.9 
 
 
255 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.96 
 
 
362 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2777  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.12 
 
 
332 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  30.8 
 
 
261 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  30.8 
 
 
261 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  31.84 
 
 
251 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  29.52 
 
 
262 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3868  ABC transporter related  31.48 
 
 
237 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  35.93 
 
 
262 aa  105  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  29.73 
 
 
247 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.5 
 
 
351 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  33.83 
 
 
267 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  31.1 
 
 
262 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  32.72 
 
 
378 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  26.84 
 
 
243 aa  104  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1796  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.86 
 
 
376 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  30.53 
 
 
250 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  30.36 
 
 
261 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>