More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3013 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3013  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0529408  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1216  ABC transporter related  54.73 
 
 		 258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000901825  normal  0.0692557 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1561  ABC transporter-related protein  54.63 
 
 		 245 aa  248  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0664  ABC transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1165  ABC transporter related  38.43 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1310  ABC transporter related  38.72 
 
 		 243 aa  168  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260124  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1376  ABC transporter related  38.72 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000264902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18110  ABC transporter related  39.08 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464021  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0897  ABC transporter related protein  39.39 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0602  ABC transporter related  37.87 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0796  ABC transporter related protein  35.94 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0474  ABC transporter related  37.71 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3458  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 236 aa  148  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.572348  normal  0.0203751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1181  ABC transporter related  35.19 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0810  ABC transporter related  32.29 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  38.33 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  33.62 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  38.46 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  35.02 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  30.21 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.08 
 
 		 375 aa  122  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.08 
 
 		 375 aa  122  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  32.37 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  32.37 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.37 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.95 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.27 
 
 		 362 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  32.63 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  31.58 
 
 		 369 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  35.4 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  32.83 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  32.74 
 
 		 329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  35.68 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  32.3 
 
 		 329 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  31.58 
 
 		 369 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26780  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  32.23 
 
 		 270 aa  118  9e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  35.24 
 
 		 262 aa  118  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.54 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  35.11 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.27 
 
 		 375 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  31.53 
 
 		 338 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  34.32 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  34.62 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  34.96 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  30.58 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2948  sulfate/thiosulfate transporter subunit  31.14 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.579552  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  35.09 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.27 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.34 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  31.14 
 
 		 370 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  31.14 
 
 		 370 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.14 
 
 		 370 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  31.58 
 
 		 369 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  31.14 
 
 		 370 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  32.13 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.5 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  35.56 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  31.14 
 
 		 388 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.04 
 
 		 373 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  31.14 
 
 		 370 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  34.96 
 
 		 253 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  32.92 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2474  FeS assembly ATPase SufC  34.76 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  37.85 
 
 		 260 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.42 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2438  FeS assembly ATPase SufC  34.76 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14650  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  34.8 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  36.54 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2483  FeS assembly ATPase SufC  34.76 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.49 
 
 		 357 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  34.31 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  31.14 
 
 		 370 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  33.47 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  33.47 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  31.98 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  33.47 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  31.14 
 
 		 368 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  31.14 
 
 		 369 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  38.24 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  31.14 
 
 		 368 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  33.48 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31 
 
 		 359 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.34 
 
 		 329 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  35.19 
 
 		 253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  35.24 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.2 
 
 		 365 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2385  FeS assembly ATPase SufC  33.04 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0576904  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  33.05 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  32 
 
 		 369 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  34.32 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 		 386 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  31.4 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  34.04 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>