More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0474 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0474  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  492  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0602  ABC transporter related  64.2 
 
 		 247 aa  344  7e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1376  ABC transporter related  59.07 
 
 		 243 aa  297  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000264902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1310  ABC transporter related  58.26 
 
 		 243 aa  295  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18110  ABC transporter related  47.62 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464021  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0796  ABC transporter related protein  43.8 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1181  ABC transporter related  44.98 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0810  ABC transporter related  43.3 
 
 		 230 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3458  ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.572348  normal  0.0203751 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0897  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1216  ABC transporter related  43.61 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000901825  normal  0.0692557 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3013  ABC transporter related  37.71 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0529408  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1561  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 		 245 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0664  ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  33.77 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  34.93 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  34.65 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1165  ABC transporter related  33.88 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01358  Cysteine desulfurase activator ATPase  35.78 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  37.56 
 
 		 239 aa  132  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  33.62 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  34.57 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  31.33 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  35.09 
 
 		 249 aa  128  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  32.91 
 
 		 250 aa  128  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1086  ABC transporter related  39.39 
 
 		 228 aa  128  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.48609  normal  0.328712 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  36.89 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0516  FeS assembly ATPase SufC  33.33 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  36.44 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  37.17 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  32.61 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  35.32 
 
 		 264 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  34.07 
 
 		 256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  32.89 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  33.61 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  32.02 
 
 		 253 aa  124  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1982  ABC-transporter ATP-binding protein  35.84 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  36.73 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  34.98 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  34.84 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0852  ABC-transporter ATP-binding protein  34.96 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556343  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  30.74 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11491  ATP-binding protein ABC transporter  33.78 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209991  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1317  FeS assembly ATPase SufC  35.02 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00252118  normal  0.400998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  32.44 
 
 		 249 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  34.01 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1259  FeS assembly ATPase SufC  35.24 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000235228  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  36.05 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  33.18 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  34.22 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  33.33 
 
 		 252 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  30.7 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  33.18 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  31.74 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  31.88 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  33.47 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  33.91 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  33.92 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  30.22 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  34.02 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  32.02 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  32.02 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  32.02 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  32.86 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  34.25 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26780  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  32.6 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  32.58 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  31.44 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  31.72 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  34.98 
 
 		 321 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  33.78 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  34.98 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  32.05 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0751  ABC transporter, ATP-binding protein  33.63 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54301  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  33.47 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14650  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  33.04 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  32.47 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  32.59 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3307  FeS assembly ATPase SufC  33.8 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000620228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  34.27 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  33.48 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0337  FeS assembly ATPase SufC  35.63 
 
 		 252 aa  118  7e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  30.84 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  32.3 
 
 		 256 aa  118  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2438  FeS assembly ATPase SufC  37.23 
 
 		 263 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2474  FeS assembly ATPase SufC  37.23 
 
 		 263 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2483  FeS assembly ATPase SufC  37.23 
 
 		 263 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  36.84 
 
 		 256 aa  118  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  33.04 
 
 		 259 aa  118  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  33.33 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  29.27 
 
 		 245 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2385  FeS assembly ATPase SufC  37.63 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0576904  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  35.19 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  33.18 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  31.14 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  33.48 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>