More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1435 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 
263 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  99.62 
 
 
263 aa  527  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0405  FeS assembly ATPase SufC  70.99 
 
 
262 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.300963  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  70.47 
 
 
262 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03031  ABC transporter, ATP binding component  65.9 
 
 
262 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  68.5 
 
 
261 aa  371  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00801  ABC transporter, ATP binding component  71.26 
 
 
257 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.681309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  68.65 
 
 
262 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00811  ABC transporter, ATP binding component  69.92 
 
 
260 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  67.47 
 
 
256 aa  361  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  67.47 
 
 
256 aa  361  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00831  ABC transporter, ATP binding component  69.17 
 
 
261 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  66.79 
 
 
260 aa  358  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00841  ABC transporter, ATP binding component  69.17 
 
 
261 aa  358  4e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.520041  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0074  FeS assembly ATPase SufC  67.98 
 
 
261 aa  355  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  65.86 
 
 
256 aa  354  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  63.89 
 
 
262 aa  349  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  65.87 
 
 
261 aa  350  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  64.59 
 
 
271 aa  348  5e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  62.7 
 
 
263 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
253 aa  323  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  60.66 
 
 
253 aa  314  9e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  58.13 
 
 
250 aa  314  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  60.66 
 
 
252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  57.32 
 
 
250 aa  312  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  59.68 
 
 
249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  59.2 
 
 
250 aa  311  9e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  59.84 
 
 
251 aa  310  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  59.43 
 
 
255 aa  310  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  57.72 
 
 
258 aa  306  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  60.48 
 
 
249 aa  306  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  57.72 
 
 
254 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  57.96 
 
 
254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  56.13 
 
 
257 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  56.35 
 
 
254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  56.18 
 
 
256 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  57.89 
 
 
259 aa  300  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  56.15 
 
 
250 aa  298  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  56.57 
 
 
261 aa  298  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  55.69 
 
 
256 aa  298  7e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  58.51 
 
 
249 aa  298  7e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  59.09 
 
 
252 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  57.79 
 
 
248 aa  297  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  57.26 
 
 
250 aa  297  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  56.15 
 
 
254 aa  295  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  56.33 
 
 
249 aa  294  8e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  58.3 
 
 
259 aa  294  9e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  56.87 
 
 
264 aa  294  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  56.15 
 
 
244 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  56.05 
 
 
249 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  56.15 
 
 
244 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  56.56 
 
 
246 aa  293  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  53.49 
 
 
261 aa  293  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  57.2 
 
 
251 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  55.65 
 
 
252 aa  293  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  55.16 
 
 
273 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  56.43 
 
 
249 aa  289  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  57.14 
 
 
256 aa  288  4e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  56.28 
 
 
261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  56.97 
 
 
248 aa  288  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  55.33 
 
 
250 aa  288  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  56.28 
 
 
261 aa  288  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  56.61 
 
 
252 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  56.28 
 
 
261 aa  288  7e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  56.28 
 
 
261 aa  288  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  56.28 
 
 
261 aa  288  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  56.28 
 
 
261 aa  288  8e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  56.28 
 
 
261 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  56.28 
 
 
261 aa  287  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  56.97 
 
 
248 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  56.28 
 
 
261 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  56.56 
 
 
248 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  55.79 
 
 
251 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  56.56 
 
 
248 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  56.28 
 
 
261 aa  287  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  56.56 
 
 
248 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  56.56 
 
 
248 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  56.28 
 
 
261 aa  287  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  56.56 
 
 
248 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  55.97 
 
 
261 aa  287  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0890  FeS assembly ATPase SufC  55.91 
 
 
268 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  55.74 
 
 
248 aa  286  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0844  FeS assembly ATPase SufC  54.02 
 
 
268 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  56.2 
 
 
252 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  55.87 
 
 
259 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 
250 aa  286  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  55.74 
 
 
248 aa  286  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  57.02 
 
 
250 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  55.79 
 
 
247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  56.56 
 
 
248 aa  285  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  55.1 
 
 
280 aa  285  4e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  55.74 
 
 
248 aa  285  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  55.74 
 
 
248 aa  285  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  55.74 
 
 
248 aa  285  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  55.74 
 
 
248 aa  285  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0894  FeS assembly ATPase SufC  55.51 
 
 
268 aa  285  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  56.28 
 
 
261 aa  284  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  55.56 
 
 
247 aa  284  9e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.515464 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  55.74 
 
 
248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  54.29 
 
 
247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>