More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1922 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  542  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  75.19 
 
 		 262 aa  407  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1972  ABC transporter related  75.39 
 
 		 258 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.161384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  74.5 
 
 		 260 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  70.52 
 
 		 252 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  69.26 
 
 		 255 aa  360  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  62.85 
 
 		 253 aa  329  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  61.6 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  56.35 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  54.18 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  53.39 
 
 		 251 aa  271  6e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  53.39 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  51.2 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  54.22 
 
 		 254 aa  266  4e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  54.22 
 
 		 243 aa  264  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  50.79 
 
 		 246 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  53.01 
 
 		 242 aa  261  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  46.99 
 
 		 246 aa  255  5e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  51.79 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  50 
 
 		 245 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 		 249 aa  248  5e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  48.19 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  46.18 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  45.7 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  45.78 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  45.38 
 
 		 248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  36.92 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  36.19 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0037  ABC transporter related  34.69 
 
 		 228 aa  159  7e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1086  ABC transporter related  35.08 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.48609  normal  0.328712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  39.3 
 
 		 257 aa  155  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  36.19 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  35.04 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  34.15 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  34.6 
 
 		 250 aa  152  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  35.27 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  35.27 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  36.05 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  36.05 
 
 		 246 aa  149  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  35.38 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1142  FeS assembly ATPase SufC  32.58 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  34.83 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  34.88 
 
 		 248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  34.39 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  35.66 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  35.27 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  34.36 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  34.88 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  37.21 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  32.7 
 
 		 256 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  34.72 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  33.73 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  34.5 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  34.25 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0566  FeS assembly ATPase SufC  33.2 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  32.21 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0337  FeS assembly ATPase SufC  36.29 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  36.73 
 
 		 249 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1205  ABC transporter related  38.74 
 
 		 240 aa  145  9e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0586887  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  34.11 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  34.11 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  34.88 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  34.88 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  33.46 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  34.88 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  34.88 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  34.88 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  34.11 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  34.88 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  34.88 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  34.38 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  34.11 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  33.58 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  33.58 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  34.5 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  33.97 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  32.32 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  34.88 
 
 		 248 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  32.95 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  33.71 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26780  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  34.38 
 
 		 270 aa  142  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  34.11 
 
 		 250 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  34.11 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  35.52 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  32.95 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  34.11 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  33.72 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  33.72 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  35.45 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  33.72 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  31.94 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  33.72 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.85 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  33.33 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  33.72 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  34.88 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  34.5 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  34.5 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>