More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0037 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0037  ABC transporter related  100 
 
 
228 aa  447  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1086  ABC transporter related  71.81 
 
 
228 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.48609  normal  0.328712 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0952  ABC transporter related  73.57 
 
 
228 aa  323  2e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000909223  hitchhiker  0.000313901 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  40.59 
 
 
248 aa  165  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  35.63 
 
 
255 aa  164  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  38.59 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  39.5 
 
 
245 aa  161  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  34.69 
 
 
264 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  34.47 
 
 
246 aa  155  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  33.06 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  34.27 
 
 
252 aa  154  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  35.56 
 
 
248 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  35.98 
 
 
248 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  37.07 
 
 
248 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  34.02 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  37.5 
 
 
251 aa  152  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  37.23 
 
 
250 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  35.32 
 
 
246 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  35.56 
 
 
249 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  46.24 
 
 
243 aa  149  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  35.15 
 
 
248 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  34.73 
 
 
248 aa  148  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  32.23 
 
 
260 aa  148  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1972  ABC transporter related  32.51 
 
 
258 aa  148  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.161384  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  34.75 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  36.29 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  35.86 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  34.68 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1841  ABC transporter related  36.21 
 
 
251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  35.54 
 
 
252 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  35.02 
 
 
245 aa  143  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  37.07 
 
 
251 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  35.29 
 
 
242 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  37.04 
 
 
246 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  36.44 
 
 
253 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  36.36 
 
 
252 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  35.68 
 
 
250 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  35.81 
 
 
248 aa  141  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  33.47 
 
 
253 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  37.07 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1310  ABC transporter related  40.18 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  36.1 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1376  ABC transporter related  40.18 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000264902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  35.54 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 
261 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  32.77 
 
 
261 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  31.38 
 
 
266 aa  139  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  35.66 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0897  ABC transporter related protein  36.56 
 
 
228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  34.89 
 
 
243 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  32.35 
 
 
261 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  32.35 
 
 
261 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  32.35 
 
 
261 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  32.35 
 
 
261 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  32.35 
 
 
261 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  32.35 
 
 
261 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  32.64 
 
 
243 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  34.73 
 
 
259 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 
250 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  32.2 
 
 
253 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  32.2 
 
 
253 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  33.33 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  31.93 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  36.14 
 
 
248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0796  ABC transporter related protein  39.8 
 
 
252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  34.57 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  33.88 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  31.93 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  35.5 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  31.93 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0516  FeS assembly ATPase SufC  34.98 
 
 
256 aa  134  9e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0177  FeS assembly ATPase SufC  33.89 
 
 
252 aa  134  9e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409985  normal  0.132248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  35.15 
 
 
256 aa  134  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18110  ABC transporter related  39.79 
 
 
241 aa  134  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464021  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  34.55 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  34.96 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  35.1 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  35.1 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  34.55 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  35.1 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  34.78 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  34.71 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  32.35 
 
 
310 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  35.12 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  34.96 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  35.12 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  35.54 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26780  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  32.77 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  35.74 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0760  FeS assembly ATPase SufC  36.53 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.107751  normal  0.952712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  33.62 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  37.83 
 
 
258 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  34.02 
 
 
247 aa  132  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  32.63 
 
 
252 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  34.48 
 
 
255 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  34.96 
 
 
248 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1744  FeS assembly ATPase SufC  35.94 
 
 
254 aa  133  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>