More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1086 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1086  ABC transporter related  100 
 
 
228 aa  448  1e-125  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.48609  normal  0.328712 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0037  ABC transporter related  71.81 
 
 
228 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0952  ABC transporter related  67.54 
 
 
228 aa  301  8.000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000909223  hitchhiker  0.000313901 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  35.74 
 
 
255 aa  175  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  34.41 
 
 
252 aa  165  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  35.02 
 
 
248 aa  159  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  34.6 
 
 
248 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  40.09 
 
 
248 aa  160  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  43.4 
 
 
243 aa  157  9e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  35.08 
 
 
264 aa  157  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  40.52 
 
 
248 aa  157  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  34.73 
 
 
246 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  34.03 
 
 
246 aa  156  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  32.26 
 
 
253 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  36.21 
 
 
245 aa  155  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  33.06 
 
 
262 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  33.33 
 
 
248 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  32.91 
 
 
248 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  36.78 
 
 
248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  32.24 
 
 
260 aa  151  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  36.97 
 
 
250 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  34.31 
 
 
266 aa  149  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  33.76 
 
 
253 aa  148  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  36.21 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  35.68 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1972  ABC transporter related  35.27 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.161384  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0177  FeS assembly ATPase SufC  35.15 
 
 
252 aa  146  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409985  normal  0.132248 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1841  ABC transporter related  35.42 
 
 
251 aa  146  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  34.69 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  37.6 
 
 
251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  32.91 
 
 
253 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1744  FeS assembly ATPase SufC  35.71 
 
 
254 aa  145  6e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  32.91 
 
 
253 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  32.77 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  38.11 
 
 
249 aa  144  9e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  35.56 
 
 
259 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1205  ABC transporter related  37.44 
 
 
240 aa  143  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0586887  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  36.61 
 
 
262 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 
261 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  33.89 
 
 
261 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 
261 aa  142  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  37.33 
 
 
251 aa  142  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  33.89 
 
 
261 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  33.89 
 
 
261 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  35.98 
 
 
242 aa  143  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 
261 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  33.89 
 
 
261 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  33.89 
 
 
261 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  36.48 
 
 
253 aa  142  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  35.42 
 
 
257 aa  141  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  33.47 
 
 
261 aa  141  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0760  FeS assembly ATPase SufC  34.87 
 
 
254 aa  141  9e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.107751  normal  0.952712 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  36.61 
 
 
243 aa  141  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  33.47 
 
 
261 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  33.89 
 
 
259 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  37.29 
 
 
264 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  37.45 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  34.85 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1310  ABC transporter related  36.77 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  33.47 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18110  ABC transporter related  39.79 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1376  ABC transporter related  36.77 
 
 
243 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000264902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  36.64 
 
 
253 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  33.93 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  36.07 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  35.29 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3458  ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 
236 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.572348  normal  0.0203751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0796  ABC transporter related protein  39.5 
 
 
252 aa  137  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 
250 aa  136  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  32.5 
 
 
246 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2474  FeS assembly ATPase SufC  35.37 
 
 
263 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249434  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2438  FeS assembly ATPase SufC  35.37 
 
 
263 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 
253 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  32.24 
 
 
256 aa  137  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2483  FeS assembly ATPase SufC  35.37 
 
 
263 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  36.89 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0897  ABC transporter related protein  35.68 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  36.48 
 
 
247 aa  135  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  36.78 
 
 
252 aa  135  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3675  FeS assembly ATPase SufC  35.68 
 
 
256 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
250 aa  135  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  36.36 
 
 
255 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  36.86 
 
 
249 aa  135  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  36.59 
 
 
248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0612  FeS assembly ATPase SufC  35.74 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  34.01 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  33.47 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  35.44 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  34.96 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  35.68 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  30.96 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  30.83 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  33.76 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  34.69 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  33.73 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  35.32 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  35.24 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2915  FeS assembly ATPase SufC  36.36 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  34.58 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>