More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_719 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  100 
 
 		 251 aa  505  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  96.81 
 
 		 251 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  96.02 
 
 		 251 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  58.61 
 
 		 254 aa  288  5.0000000000000004e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  54.55 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  55.95 
 
 		 251 aa  285  5e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  57.14 
 
 		 246 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  56 
 
 		 262 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  57.2 
 
 		 260 aa  280  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1972  ABC transporter related  56.18 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.161384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  53.57 
 
 		 254 aa  275  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  53.97 
 
 		 252 aa  275  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  53.28 
 
 		 246 aa  272  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  53.39 
 
 		 264 aa  271  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  54.07 
 
 		 245 aa  271  6e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  53.69 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  54.55 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 		 247 aa  267  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  48.16 
 
 		 246 aa  263  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  51.22 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  49.39 
 
 		 248 aa  262  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  51.76 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  50 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  49.59 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  49.59 
 
 		 248 aa  258  8e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  52.02 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  40.8 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  39.04 
 
 		 248 aa  176  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  38.06 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  37.97 
 
 		 243 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  36.25 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  38.21 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  37.5 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  37.5 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0337  FeS assembly ATPase SufC  39.44 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  36.9 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  39.08 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  37.4 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  37.4 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  37.4 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  37.55 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0566  FeS assembly ATPase SufC  36.65 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  37.4 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  34.66 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  35.63 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  38.71 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  40 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  36.59 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  38.52 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  35.22 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1137  FeS assembly ATPase SufC  38.58 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.324053  normal  0.0277832 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  34.66 
 
 		 253 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  34.66 
 
 		 253 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  37.34 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  37.3 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14650  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  39.68 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  35.83 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  37.11 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  38.85 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  38.49 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  37.98 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  34.92 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  37.6 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  36.84 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0708  FeS assembly ATPase SufC  37.6 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  37.74 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2507  FeS assembly ATPase SufC  37.7 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2088  FeS assembly ATPase SufC  39.15 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  35.25 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  36.61 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  37.55 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  40.16 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  36.02 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2915  FeS assembly ATPase SufC  36.51 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  36.08 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  36.55 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  34.54 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  36.02 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  35.74 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  35.69 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  34.15 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  37.65 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  37.45 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  36.25 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  35.89 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  36.44 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1663  FeS assembly ATPase SufC  38.52 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  36.72 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  39.76 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  37.75 
 
 		 262 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  35.25 
 
 		 271 aa  155  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  37.5 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1360  FeS assembly ATPase SufC  37.25 
 
 		 255 aa  154  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>