More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1811 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  525  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  76.77 
 
 		 260 aa  401  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  72.16 
 
 		 252 aa  396  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  74.51 
 
 		 262 aa  391  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1972  ABC transporter related  73.73 
 
 		 258 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.161384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  69.26 
 
 		 264 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  67.72 
 
 		 253 aa  358  6e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  62.2 
 
 		 254 aa  315  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  53.54 
 
 		 251 aa  278  7e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  54.12 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  55.51 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  53.15 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  50.19 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  50.98 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  51.76 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  51.37 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  51.57 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  53.54 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  50.98 
 
 		 251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  50.99 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  49.41 
 
 		 248 aa  254  7e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  51.18 
 
 		 245 aa  253  3e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  49.01 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 		 249 aa  249  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  48.62 
 
 		 248 aa  249  4e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  49.41 
 
 		 247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  47.86 
 
 		 246 aa  244  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1086  ABC transporter related  35.74 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.48609  normal  0.328712 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  36.98 
 
 		 248 aa  168  9e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0037  ABC transporter related  35.63 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  39.5 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  36.93 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  38.17 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  38.21 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  35.14 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  37.79 
 
 		 246 aa  149  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  35.15 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  36.86 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  33.21 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  33.08 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0337  FeS assembly ATPase SufC  35.88 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  38.91 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  33.2 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  33.59 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  36.4 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0666  FeS assembly ATPase SufC  31.58 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  35.56 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  36.4 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  34.11 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  32.95 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  32.91 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  35.56 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  34.02 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  34.7 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  38.33 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  35.15 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  35.02 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  31.72 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  34.29 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  34.73 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  32.83 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  34.29 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  34.71 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  35.56 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  33.33 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1142  FeS assembly ATPase SufC  32.44 
 
 		 250 aa  139  6e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  34.73 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  34.73 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 250 aa  138  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  34.73 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  34.73 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  34.73 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  34.73 
 
 		 248 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  34.73 
 
 		 248 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  33.84 
 
 		 257 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  33.08 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0952  ABC transporter related  32.43 
 
 		 228 aa  138  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000909223  hitchhiker  0.000313901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  34.31 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1193  FeS assembly ATPase SufC  34.46 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  34.07 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  31.8 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  35.83 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  34.73 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  29.52 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  34.73 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  34.73 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  36.1 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  31.84 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  33.47 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  34.73 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  33.87 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  32.44 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  34.73 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  31.72 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0051  FeS assembly ATPase SufC  32.58 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0644623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  34.73 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  34.73 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  33.07 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>