More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0419 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  100 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  97.58 
 
 
248 aa  493  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  96.37 
 
 
248 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  91.13 
 
 
248 aa  470  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  72.13 
 
 
246 aa  368  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  53.33 
 
 
245 aa  271  8.000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0164  ABC transporter related  54 
 
 
254 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269134  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2223  ABC transporter-related protein  53.31 
 
 
243 aa  269  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0547  ABC transporter related protein  51.2 
 
 
262 aa  268  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0314778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  53.06 
 
 
246 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0461  ABC transporter related  50.62 
 
 
245 aa  262  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0260  ABC transporter related  50.42 
 
 
254 aa  259  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.664002  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  51.67 
 
 
242 aa  258  6e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  49.59 
 
 
251 aa  258  8e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  48.98 
 
 
251 aa  257  1e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  47.13 
 
 
246 aa  256  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  49.19 
 
 
251 aa  256  3e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1000  ABC transporter related  46.4 
 
 
252 aa  254  6e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17941  hitchhiker  0.00974436 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0914  ABC transporter related  49.19 
 
 
262 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0108462 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1200  ABC transporter related  47.04 
 
 
253 aa  251  8.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0464607 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  49.6 
 
 
251 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1445  ATPase  48.79 
 
 
260 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.152144  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1811  ABC transporter related  48.62 
 
 
255 aa  249  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0948507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1972  ABC transporter related  47.6 
 
 
258 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.161384  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
247 aa  244  6.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1922  ABC transporter related  45.78 
 
 
264 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0491  ABC transporter, ATPase subunit  47.13 
 
 
249 aa  235  6e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  44.76 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  44.35 
 
 
246 aa  182  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1259  FeS assembly ATPase SufC  41.94 
 
 
244 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000235228  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  40.73 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  41.6 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  39.92 
 
 
257 aa  169  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  42.23 
 
 
243 aa  169  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0666  FeS assembly ATPase SufC  39.02 
 
 
246 aa  166  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0760  FeS assembly ATPase SufC  36.19 
 
 
254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.107751  normal  0.952712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  38.37 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  40.32 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  41.13 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0177  FeS assembly ATPase SufC  37.5 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409985  normal  0.132248 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1744  FeS assembly ATPase SufC  36.96 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  34.6 
 
 
243 aa  162  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  38.8 
 
 
254 aa  162  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0566  FeS assembly ATPase SufC  36.84 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  40.24 
 
 
257 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  39.76 
 
 
250 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  39.57 
 
 
248 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1142  FeS assembly ATPase SufC  38.31 
 
 
250 aa  155  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  39.57 
 
 
248 aa  155  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0051  FeS assembly ATPase SufC  39.84 
 
 
247 aa  155  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0644623  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  37.8 
 
 
247 aa  155  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  37.7 
 
 
263 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  36.33 
 
 
253 aa  155  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1086  ABC transporter related  32.91 
 
 
228 aa  154  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.48609  normal  0.328712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  37.35 
 
 
251 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  36.4 
 
 
248 aa  154  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  38.34 
 
 
250 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  39.57 
 
 
248 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  37.45 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0337  FeS assembly ATPase SufC  37.45 
 
 
252 aa  152  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  36.65 
 
 
256 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  38.25 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  36.55 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
256 aa  152  7e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 
250 aa  151  8.999999999999999e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  36.76 
 
 
249 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  35.46 
 
 
256 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  39.57 
 
 
248 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  39.57 
 
 
248 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  38.15 
 
 
248 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  38.3 
 
 
248 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  39.57 
 
 
248 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  39.57 
 
 
248 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  39.57 
 
 
248 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  34.9 
 
 
253 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  37.35 
 
 
255 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  38.4 
 
 
259 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  36.4 
 
 
262 aa  149  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  38.28 
 
 
256 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0612  FeS assembly ATPase SufC  35.89 
 
 
258 aa  149  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  40 
 
 
266 aa  149  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  39.5 
 
 
249 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0402  FeS assembly ATPase SufC  34.5 
 
 
255 aa  149  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000798388  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  37.35 
 
 
252 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  36 
 
 
265 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  36.59 
 
 
261 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0037  ABC transporter related  34.73 
 
 
228 aa  148  6e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  38.3 
 
 
248 aa  148  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  38.3 
 
 
248 aa  148  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26780  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  35.63 
 
 
270 aa  148  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  38.3 
 
 
248 aa  148  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  38.3 
 
 
248 aa  148  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  38.3 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  36.8 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  37.35 
 
 
250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  38.3 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  38.3 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  37.4 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  37.05 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  34.38 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>