More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2307 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2307  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
515 aa  1016    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5711  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  33.93 
 
 
529 aa  220  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2051  extracellular solute-binding protein family 5  34.65 
 
 
522 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  29.12 
 
 
505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  24.44 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.2 
 
 
508 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 
522 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4082  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
526 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484283  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 
551 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  33.13 
 
 
506 aa  104  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.4 
 
 
519 aa  103  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.61 
 
 
510 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 
535 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 
542 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3985  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
499 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  31.8 
 
 
532 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
510 aa  101  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  26.65 
 
 
504 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
529 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  25.95 
 
 
537 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 
537 aa  99  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  25.95 
 
 
537 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
537 aa  99  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  25.95 
 
 
537 aa  99  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  25.95 
 
 
537 aa  99  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  25.95 
 
 
537 aa  99  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  25.76 
 
 
537 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
504 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.47 
 
 
516 aa  97.8  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 
541 aa  97.4  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.97 
 
 
511 aa  97.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 
509 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  28.71 
 
 
508 aa  97.1  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.78 
 
 
521 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.78 
 
 
521 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.78 
 
 
521 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
521 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.78 
 
 
521 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0449  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 
522 aa  96.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  26.74 
 
 
560 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
492 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 
512 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  25.33 
 
 
537 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
489 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 
512 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 
524 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.74 
 
 
532 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 
512 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 
490 aa  95.9  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.53 
 
 
533 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 
555 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
510 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.16 
 
 
540 aa  94.7  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.03 
 
 
507 aa  94  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 
513 aa  93.6  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
492 aa  93.6  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  24.37 
 
 
509 aa  93.6  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.82 
 
 
516 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  25.97 
 
 
537 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.27 
 
 
542 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.4 
 
 
512 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  25.74 
 
 
513 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  28.77 
 
 
610 aa  92.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  28.77 
 
 
551 aa  92.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0927  extracellular solute-binding protein family 5  31.74 
 
 
544 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.887829  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.4 
 
 
512 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  24.71 
 
 
544 aa  91.7  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  24.74 
 
 
529 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
521 aa  91.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  26.06 
 
 
517 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 
517 aa  91.7  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.4 
 
 
512 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5116  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 
532 aa  91.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.682235 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.4 
 
 
512 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.4 
 
 
512 aa  91.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  28.4 
 
 
512 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5044  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 
566 aa  91.3  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  28.4 
 
 
512 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
512 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.51 
 
 
542 aa  90.9  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  22.24 
 
 
528 aa  90.9  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 
535 aa  90.9  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  25.81 
 
 
537 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.94 
 
 
493 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  27.64 
 
 
556 aa  90.5  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 
518 aa  90.5  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  23.82 
 
 
529 aa  90.5  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
536 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.81 
 
 
492 aa  90.1  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  25.9 
 
 
537 aa  90.1  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0365  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.62 
 
 
521 aa  90.1  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  25.9 
 
 
537 aa  90.1  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.64 
 
 
540 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.56 
 
 
528 aa  89.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 
554 aa  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 
504 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
556 aa  89.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  25.71 
 
 
537 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.65 
 
 
479 aa  89.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
515 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>