More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2051 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2051  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
522 aa  1041    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5711  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  37.97 
 
 
529 aa  312  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2307  extracellular solute-binding protein family 5  34.41 
 
 
515 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 
541 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  30.88 
 
 
554 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 
537 aa  120  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  26.95 
 
 
537 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 
542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
555 aa  117  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 
551 aa  114  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.56 
 
 
516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  29.44 
 
 
532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.87 
 
 
521 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.87 
 
 
521 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.87 
 
 
521 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
521 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.87 
 
 
521 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.45 
 
 
550 aa  109  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
511 aa  107  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.41 
 
 
510 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5289  ABC transporter  26.02 
 
 
517 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0912186  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1779  extracellular solute-binding protein family 5  28.05 
 
 
547 aa  104  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
510 aa  103  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 
506 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
555 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
535 aa  100  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.04 
 
 
505 aa  99.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 
556 aa  98.6  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3755  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
557 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
546 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
546 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
517 aa  95.9  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  28.99 
 
 
546 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  25.82 
 
 
524 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
505 aa  95.9  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
508 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 
552 aa  95.9  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0239  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.55 
 
 
524 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  25.55 
 
 
524 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
528 aa  94.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.55 
 
 
524 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  25.55 
 
 
524 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1834  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.19 
 
 
523 aa  94.7  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250373  hitchhiker  0.0023879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  27.63 
 
 
551 aa  94.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5184  ABC-type transporter, substrate binding protein  26.33 
 
 
550 aa  94.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3845  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  25.55 
 
 
524 aa  94.4  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.34 
 
 
540 aa  94  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
533 aa  93.6  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
512 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
512 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
512 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  25.55 
 
 
524 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 
535 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  25.27 
 
 
524 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03278  hypothetical protein  25.27 
 
 
524 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
539 aa  92.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.35 
 
 
546 aa  92.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  25.44 
 
 
509 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 
607 aa  91.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.95 
 
 
524 aa  91.3  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 
544 aa  90.9  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  28.76 
 
 
551 aa  90.9  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2510  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
519 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 
559 aa  90.9  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
546 aa  90.5  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 
515 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 
544 aa  90.1  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  26.3 
 
 
522 aa  90.1  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 
525 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 
527 aa  89.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
510 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  30.05 
 
 
509 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.59 
 
 
524 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  28.88 
 
 
560 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3647  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 
556 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0862095  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
512 aa  89  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.07 
 
 
532 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3498  extracellular solute-binding protein family 5  29.33 
 
 
560 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.716688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
540 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  26.43 
 
 
537 aa  88.2  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 
536 aa  88.6  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1897  extracellular solute-binding protein family 5  27.82 
 
 
554 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 
534 aa  87.8  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3088  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein, putative  25.81 
 
 
542 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.51 
 
 
507 aa  87.4  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 
533 aa  87  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.93 
 
 
527 aa  87  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 
517 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  25 
 
 
524 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
493 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 
533 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0295  extracellular solute-binding protein family 5  23.98 
 
 
558 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 
539 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4320  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 
554 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  25.8 
 
 
535 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 
516 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4820  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
556 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1578  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 
595 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.259952  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.8 
 
 
535 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  26.05 
 
 
535 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>