More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1820 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0380  acetoacetyl-CoA synthetase  54.94 
 
 
650 aa  713    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3071  acetoacetyl-CoA synthetase  57.85 
 
 
650 aa  752    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.922751  normal  0.501607 
 
 
-
 
NC_004310  BR0021  acetoacetyl-CoA synthetase  54.39 
 
 
662 aa  721    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1794  acetoacetyl-CoA synthetase  54.59 
 
 
646 aa  740    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1795  acetoacetyl-CoA synthetase  54.59 
 
 
646 aa  738    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0177  acetoacetyl-CoA synthetase  57.85 
 
 
651 aa  776    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2047  acetoacetyl-CoA synthetase  61.27 
 
 
651 aa  813    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3080  acetoacetyl-CoA synthetase  54.92 
 
 
651 aa  738    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0018  acetoacetyl-CoA synthetase  54.24 
 
 
662 aa  720    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677245  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2028  acetoacetyl-CoA synthetase  61.96 
 
 
651 aa  814    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720983  normal  0.488067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0554  acetoacetyl-CoA synthase  56.81 
 
 
658 aa  751    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3695  acetoacetyl-CoA synthetase  54.63 
 
 
668 aa  695    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506313  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2653  acetoacetyl-CoA synthetase  58.01 
 
 
650 aa  746    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1658  acetoacetyl-CoA synthetase  57.96 
 
 
662 aa  715    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1820  acetoacetyl-CoA synthetase  100 
 
 
649 aa  1336    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000185409  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3889  acetoacetyl-CoA synthase  56.36 
 
 
653 aa  747    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00052085  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0412  acetoacetyl-CoA synthetase  55.04 
 
 
650 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0370757  hitchhiker  0.0000659795 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1185  acetoacetyl-CoA synthetase  49.15 
 
 
650 aa  669    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3297  acetoacetyl-CoA synthetase  59.57 
 
 
651 aa  781    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1610  acetoacetyl-CoA synthase  53.7 
 
 
651 aa  741    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.787437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0168  acetoacetyl-CoA synthetase  55.86 
 
 
652 aa  733    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2108  acetoacetyl-CoA synthetase  52.01 
 
 
651 aa  647    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.188473 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0779  acetoacetyl-CoA synthetase  49 
 
 
650 aa  668    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38690  acetoacetyl-CoA synthetase  58.9 
 
 
651 aa  781    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0036  acetoacetyl-CoA synthetase  54.78 
 
 
662 aa  722    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2795  acetoacetyl-CoA synthetase  56.84 
 
 
652 aa  747    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  0.10488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0315  acetoacetyl-CoA synthetase  54.18 
 
 
650 aa  706    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4886  acetoacetyl-CoA synthase  52.38 
 
 
657 aa  759    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2720  acetoacetyl-CoA synthetase  57.3 
 
 
653 aa  764    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.0612564 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1247  acetoacetyl-CoA synthase  54.08 
 
 
651 aa  733    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.916706  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1714  acetoacetyl-CoA synthetase  48.85 
 
 
687 aa  623  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.776218  normal  0.102104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3829  acetoacetyl-CoA synthetase  49.38 
 
 
657 aa  617  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1953  acetoacetyl-CoA synthetase  48.61 
 
 
657 aa  604  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2277  acetoacetyl-CoA synthetase  46.77 
 
 
667 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3294  acetoacetyl-CoA synthetase  47.23 
 
 
676 aa  598  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05420  acetoacetyl-CoA synthetase  44.85 
 
 
656 aa  598  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0406  acetoacetyl-CoA synthetase  46.39 
 
 
659 aa  591  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000302212  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001479  acetoacetyl-CoA synthetase  44.22 
 
 
657 aa  588  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.525178  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0246  acetoacetyl-CoA synthetase  47.21 
 
 
661 aa  591  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0788  acetoacetyl-CoA synthase  48.53 
 
 
645 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1970  acetoacetyl-CoA synthetase  45.08 
 
 
676 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129339  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0089  acetoacetyl-CoA synthetase  46.11 
 
 
662 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848036  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4014  acetoacetyl-CoA synthase  47 
 
 
667 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000409  acetoacetyl-CoA synthetase  43.31 
 
 
695 aa  569  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0879  acetoacetyl-CoA synthetase  47.38 
 
 
664 aa  571  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.361725  normal  0.0726893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2342  acetoacetyl-CoA synthetase  46.75 
 
 
660 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0937  acetoacetyl-CoA synthetase  46.64 
 
 
665 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2699  acetoacetyl-CoA synthetase  43.59 
 
 
669 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3504  acetoacetyl-CoA synthetase  45.54 
 
 
709 aa  550  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.315612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2245  acetoacetyl-CoA synthetase  46.52 
 
 
654 aa  545  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115691  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0764  acetoacetyl-CoA synthetase  43.03 
 
 
671 aa  545  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6018  acetoacetyl-CoA synthase  46.06 
 
 
667 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1444  acetyl-CoA synthetase  44.36 
 
 
681 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4421  acetoacetyl-CoA synthase  42.24 
 
 
656 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4482  acetoacetyl-CoA synthase  45.85 
 
 
662 aa  536  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.984378  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0006  acetoacetyl-CoA synthetase  45.03 
 
 
646 aa  537  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.497617  normal  0.392863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3253  acetoacetyl-CoA synthase  43.68 
 
 
685 aa  534  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2192  acetoacetyl-CoA synthetase  44.99 
 
 
669 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175358  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3920  acetoacetyl-CoA synthase  43.43 
 
 
649 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0152  acetoacetyl-CoA synthase  47.21 
 
 
651 aa  533  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2133  acetoacetyl-CoA synthase  42.86 
 
 
667 aa  535  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569736  decreased coverage  0.00936242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1209  acetoacetyl-CoA synthetase  43.66 
 
 
665 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926672  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01880  acetoacetyl-CoA synthase  43.91 
 
 
673 aa  522  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2270  acetoacetyl-CoA synthase  41.78 
 
 
654 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1569  acetoacetyl-CoA synthetase  43.43 
 
 
664 aa  521  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1473  acetoacetyl-CoA synthetase  43.67 
 
 
637 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598373  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1154  acetoacetyl-CoA synthetase  41.59 
 
 
666 aa  512  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal  0.586098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4892  acetoacetyl-CoA synthase  42.44 
 
 
666 aa  510  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3863  acetoacetyl-CoA synthase  42.62 
 
 
669 aa  511  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556445  normal  0.0884622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4181  acetoacetyl-CoA synthase  39.57 
 
 
646 aa  505  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.166817  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5085  acetoacetyl-CoA synthetase  44.36 
 
 
643 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293812  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0655  acetoacetyl-CoA synthetase  42.73 
 
 
684 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0662658 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01103  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_1G11880)  43.45 
 
 
690 aa  504  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4700  acetoacetyl-CoA synthetase  44.36 
 
 
643 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4786  acetoacetyl-CoA synthetase  44.36 
 
 
643 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434813  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0699  acetoacetyl-CoA synthetase  42.48 
 
 
684 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0880431  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0304  acetoacetyl-CoA synthase  42.28 
 
 
667 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5298  acetoacetyl-CoA synthetase  43.32 
 
 
632 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04900  conserved hypothetical protein  41.19 
 
 
698 aa  484  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0107  acetoacetyl-CoA synthetase  39.91 
 
 
671 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.924378  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0074  acetoacetyl-CoA synthetase  40.2 
 
 
695 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0087  acetoacetyl-CoA synthetase  39.85 
 
 
704 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.387097  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0119  acetoacetyl-CoA synthetase  40.38 
 
 
727 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3179  acetoacetyl-CoA synthetase  40.18 
 
 
695 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3963  acetoacetyl-CoA synthetase  39.11 
 
 
711 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0120  acetoacetyl-CoA synthetase  39.01 
 
 
696 aa  452  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.666374  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1363  acetoacetyl-CoA synthase  41.41 
 
 
654 aa  450  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1149  acetoacetyl-CoA synthase  40.59 
 
 
654 aa  443  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.335784  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2019  acetoacetyl-CoA synthase  40.09 
 
 
658 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000482159  normal  0.0114668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4720  acetoacetyl-CoA synthase  38.4 
 
 
1021 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7003  acetoacetyl-CoA synthase  40.38 
 
 
1056 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3315  acetoacetyl-CoA synthase  39.94 
 
 
620 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0916  acetoacetyl-CoA synthase  39.5 
 
 
971 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0443  acetoacetyl-CoA synthase  41.52 
 
 
988 aa  412  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303442  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01482  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_8G04770)  35.05 
 
 
698 aa  403  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 
568 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280007 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
670 aa  300  6e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0054  acetoacetyl-CoA synthetase  41.32 
 
 
754 aa  293  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 
642 aa  290  8e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2056  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 
663 aa  286  9e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>