More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0990 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
670 aa  1365    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2056  AMP-dependent synthetase and ligase  75.23 
 
 
663 aa  1022    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2583  AMP-dependent synthetase and ligase  77.56 
 
 
674 aa  1066    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319993  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  75.37 
 
 
694 aa  1057    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  46.13 
 
 
663 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0770781  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  41.14 
 
 
642 aa  546  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2222  AMP-dependent synthetase and ligase  40.15 
 
 
641 aa  520  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7155  AMP-dependent synthetase and ligase  40.09 
 
 
668 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2554  acetoacetyl-CoA synthase, putative  40.79 
 
 
646 aa  502  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2609  putative acetoacetyl-CoA synthase  41.1 
 
 
646 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2333  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  40.94 
 
 
646 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2292  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  40.57 
 
 
646 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.365139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2517  putative acetoacetyl-CoA synthase  40.94 
 
 
646 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2566  putative acetoacetyl-CoA synthase  40.94 
 
 
646 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000120954 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2376  acetoacetyl-CoA synthase  40.64 
 
 
646 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.381353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2553  acetoacetyl-CoA synthase  40.64 
 
 
646 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  40.94 
 
 
646 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0926585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2806  putative acetoacetyl-CoA synthase  40.64 
 
 
646 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.846139  hitchhiker  0.00209693 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  40.33 
 
 
646 aa  497  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2113  AMP-dependent synthetase and ligase  41.45 
 
 
643 aa  495  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  39.72 
 
 
650 aa  489  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  39.42 
 
 
650 aa  485  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  42.3 
 
 
638 aa  476  1e-133  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  42.35 
 
 
649 aa  471  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3467  AMP-dependent synthetase and ligase  39.27 
 
 
670 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  38.25 
 
 
653 aa  468  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  39.19 
 
 
651 aa  457  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  39.4 
 
 
655 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  39.4 
 
 
655 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  36.83 
 
 
666 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  39.54 
 
 
660 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  37.95 
 
 
670 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  38.19 
 
 
649 aa  453  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  38.31 
 
 
666 aa  450  1e-125  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  39.13 
 
 
667 aa  449  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  37.58 
 
 
639 aa  443  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  37.23 
 
 
666 aa  444  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  37.41 
 
 
657 aa  444  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  36.55 
 
 
648 aa  445  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  37.22 
 
 
656 aa  443  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  36.04 
 
 
660 aa  444  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  37.94 
 
 
644 aa  441  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  37.1 
 
 
667 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  40 
 
 
651 aa  442  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  38.34 
 
 
648 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  37.88 
 
 
664 aa  442  9.999999999999999e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  39.61 
 
 
668 aa  441  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  39.39 
 
 
658 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  39.4 
 
 
649 aa  440  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0866  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 
641 aa  437  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0265876 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  37.96 
 
 
638 aa  438  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  38.7 
 
 
655 aa  439  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  35.76 
 
 
631 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  35.89 
 
 
636 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  36.04 
 
 
655 aa  432  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01080  acetyl-coenzyme A synthetase  41.35 
 
 
650 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  39.93 
 
 
667 aa  435  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  34.98 
 
 
632 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  37.09 
 
 
666 aa  430  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  35.14 
 
 
632 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  37.44 
 
 
639 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  37.07 
 
 
653 aa  432  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  37.84 
 
 
656 aa  431  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  34.98 
 
 
631 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  35.41 
 
 
636 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  36.74 
 
 
655 aa  431  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  35.41 
 
 
664 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  35.57 
 
 
636 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  37.89 
 
 
659 aa  430  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  35.26 
 
 
664 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  35.66 
 
 
664 aa  428  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  36.34 
 
 
656 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  36.4 
 
 
652 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  37.4 
 
 
649 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  37.34 
 
 
663 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  39.08 
 
 
667 aa  425  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  39.19 
 
 
657 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  36.24 
 
 
661 aa  425  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  40.03 
 
 
670 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1099  acetate/CoA ligase  38.91 
 
 
700 aa  425  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  36.08 
 
 
657 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  38.67 
 
 
656 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  38.1 
 
 
646 aa  423  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  35.89 
 
 
658 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  38.77 
 
 
651 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3916  acetate/CoA ligase  38.84 
 
 
648 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  38.42 
 
 
715 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  38.88 
 
 
674 aa  420  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  37.35 
 
 
644 aa  422  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  38.83 
 
 
654 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  35.94 
 
 
656 aa  419  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  38.31 
 
 
661 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  37.97 
 
 
661 aa  418  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  38.1 
 
 
661 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  38.54 
 
 
629 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  36.04 
 
 
657 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  36.5 
 
 
658 aa  419  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  35.89 
 
 
655 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  36.58 
 
 
654 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  35.98 
 
 
649 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>