More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2056 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  75 
 
 
694 aa  1046    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2583  AMP-dependent synthetase and ligase  76.89 
 
 
674 aa  1047    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319993  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2056  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
663 aa  1349    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  75.23 
 
 
670 aa  1022    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  46.78 
 
 
663 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0770781  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  41.1 
 
 
642 aa  541  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2222  AMP-dependent synthetase and ligase  40.03 
 
 
641 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2554  acetoacetyl-CoA synthase, putative  40 
 
 
646 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2376  acetoacetyl-CoA synthase  39.7 
 
 
646 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.381353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2333  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  39.85 
 
 
646 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2292  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  40 
 
 
646 aa  505  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.365139  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7155  AMP-dependent synthetase and ligase  41.82 
 
 
668 aa  505  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2553  acetoacetyl-CoA synthase  39.7 
 
 
646 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2566  putative acetoacetyl-CoA synthase  39.85 
 
 
646 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000120954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2806  putative acetoacetyl-CoA synthase  39.7 
 
 
646 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.846139  hitchhiker  0.00209693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2609  putative acetoacetyl-CoA synthase  39.85 
 
 
646 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  39.55 
 
 
646 aa  504  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0926585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  38.79 
 
 
646 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2517  putative acetoacetyl-CoA synthase  39.7 
 
 
646 aa  501  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2113  AMP-dependent synthetase and ligase  40.63 
 
 
643 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  39.53 
 
 
650 aa  481  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  39.07 
 
 
650 aa  480  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3467  AMP-dependent synthetase and ligase  40.33 
 
 
670 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  38.6 
 
 
653 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  42.16 
 
 
638 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  39.94 
 
 
644 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  38.84 
 
 
666 aa  462  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  38.84 
 
 
667 aa  464  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  39.63 
 
 
670 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  39.9 
 
 
660 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0866  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 
641 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0265876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  40.25 
 
 
649 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  38.72 
 
 
660 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  38.17 
 
 
666 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  42.27 
 
 
649 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  40.25 
 
 
655 aa  452  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  40.25 
 
 
655 aa  452  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  37.66 
 
 
638 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  38.6 
 
 
668 aa  444  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1099  acetate/CoA ligase  39.76 
 
 
700 aa  443  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  36.76 
 
 
648 aa  444  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  38.89 
 
 
656 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  38.95 
 
 
656 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  40.41 
 
 
664 aa  440  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  39.51 
 
 
659 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  37.92 
 
 
657 aa  436  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  38.85 
 
 
651 aa  437  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  38.99 
 
 
666 aa  437  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  38.18 
 
 
655 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  39.15 
 
 
667 aa  437  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  36.87 
 
 
655 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  38.18 
 
 
639 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  35.73 
 
 
632 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  38.04 
 
 
664 aa  435  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  39.06 
 
 
667 aa  432  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  38.11 
 
 
661 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  37.12 
 
 
631 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  35.57 
 
 
632 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  38.96 
 
 
658 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  39.52 
 
 
649 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  40.03 
 
 
667 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  37.32 
 
 
664 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  37.16 
 
 
664 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  36.49 
 
 
666 aa  426  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  39.68 
 
 
670 aa  429  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  38.64 
 
 
657 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  38.93 
 
 
661 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  38.83 
 
 
715 aa  429  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  36.28 
 
 
631 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  37.35 
 
 
652 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  37.13 
 
 
656 aa  428  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  37.29 
 
 
639 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  36.34 
 
 
648 aa  429  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  37.38 
 
 
658 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  39.84 
 
 
651 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  37.46 
 
 
658 aa  426  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  36.61 
 
 
658 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  38.37 
 
 
673 aa  425  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  36.81 
 
 
657 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  39.69 
 
 
661 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  36.89 
 
 
645 aa  423  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2788  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 
608 aa  420  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  37.15 
 
 
652 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  38.27 
 
 
657 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  37.04 
 
 
680 aa  420  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  36.91 
 
 
656 aa  419  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  36.14 
 
 
636 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  39.67 
 
 
661 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  38.11 
 
 
652 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  38.11 
 
 
652 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  39.57 
 
 
654 aa  419  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  36.3 
 
 
636 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03901  hypothetical protein  38.11 
 
 
652 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  38.11 
 
 
652 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4531  acetyl-CoA synthetase  38.11 
 
 
652 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  39.33 
 
 
651 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  37.37 
 
 
644 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  38.11 
 
 
652 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  38.44 
 
 
654 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  38.78 
 
 
652 aa  418  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>