More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1441 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  53.19 
 
 
663 aa  682    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0770781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  49.77 
 
 
646 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2554  acetoacetyl-CoA synthase, putative  49.45 
 
 
646 aa  647    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2376  acetoacetyl-CoA synthase  49.77 
 
 
646 aa  649    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.381353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2333  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  49.61 
 
 
646 aa  649    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2292  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  49.61 
 
 
646 aa  650    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.365139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2553  acetoacetyl-CoA synthase  49.77 
 
 
646 aa  649    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  49.61 
 
 
646 aa  652    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0926585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2806  putative acetoacetyl-CoA synthase  49.61 
 
 
646 aa  644    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.846139  hitchhiker  0.00209693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2566  putative acetoacetyl-CoA synthase  49.61 
 
 
646 aa  649    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000120954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2609  putative acetoacetyl-CoA synthase  49.77 
 
 
646 aa  650    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
642 aa  1306    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2222  AMP-dependent synthetase and ligase  73.59 
 
 
641 aa  968    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2517  putative acetoacetyl-CoA synthase  49.77 
 
 
646 aa  645    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3467  AMP-dependent synthetase and ligase  50.15 
 
 
670 aa  605  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 
694 aa  555  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0166  AMP-dependent synthetase and ligase  46.88 
 
 
623 aa  549  1e-155  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2583  AMP-dependent synthetase and ligase  41.11 
 
 
674 aa  546  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319993  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  41.14 
 
 
670 aa  546  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7155  AMP-dependent synthetase and ligase  43.8 
 
 
668 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2056  AMP-dependent synthetase and ligase  41.1 
 
 
663 aa  541  9.999999999999999e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2113  AMP-dependent synthetase and ligase  44.72 
 
 
643 aa  535  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7333  AMP-dependent synthetase and ligase  43.25 
 
 
650 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2788  AMP-dependent synthetase and ligase  42.63 
 
 
608 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374642  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0866  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 
641 aa  503  1e-141  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0265876 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1428  AMP-dependent synthetase and ligase  41.59 
 
 
640 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922087  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  41.61 
 
 
648 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6401  AMP-dependent synthetase and ligase  41.59 
 
 
640 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172099  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  41.55 
 
 
650 aa  491  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  40.71 
 
 
670 aa  491  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1821  AMP-dependent synthetase and ligase  40.85 
 
 
652 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  41.9 
 
 
639 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  42.12 
 
 
649 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  41.39 
 
 
650 aa  481  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6450  AMP-dependent synthetase and ligase  41.93 
 
 
650 aa  482  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  hitchhiker  0.0000000000000110833 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  42.63 
 
 
638 aa  479  1e-134  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  41.57 
 
 
631 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  40.79 
 
 
632 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  40.79 
 
 
631 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  40.62 
 
 
632 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  41.2 
 
 
639 aa  474  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  39.34 
 
 
653 aa  470  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  42.12 
 
 
655 aa  470  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  41.15 
 
 
650 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  39.66 
 
 
660 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  41.2 
 
 
651 aa  464  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  40.98 
 
 
644 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  40.29 
 
 
660 aa  463  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  41.73 
 
 
659 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  40.35 
 
 
667 aa  460  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  39.28 
 
 
638 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  38.78 
 
 
651 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  40.13 
 
 
666 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  40.06 
 
 
655 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  39.03 
 
 
608 aa  450  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0200095  normal  0.25307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  40.75 
 
 
654 aa  452  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  40.06 
 
 
655 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  39.21 
 
 
652 aa  452  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  40.58 
 
 
656 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  39.25 
 
 
666 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  39 
 
 
652 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  40.76 
 
 
629 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  39.57 
 
 
656 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  39.17 
 
 
661 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  39.02 
 
 
629 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  38.99 
 
 
648 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  38.75 
 
 
632 aa  444  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  38.49 
 
 
647 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  38.84 
 
 
652 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  38.24 
 
 
664 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  39.04 
 
 
655 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3517  acetate/CoA ligase  37.64 
 
 
632 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  39.02 
 
 
656 aa  442  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  39.2 
 
 
661 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  40.9 
 
 
657 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2042  acetate/CoA ligase  38 
 
 
636 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155231  normal  0.184669 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  38.68 
 
 
652 aa  445  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  37.5 
 
 
666 aa  443  1e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  38.03 
 
 
648 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  40.65 
 
 
670 aa  440  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  40.16 
 
 
656 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  38.97 
 
 
649 aa  442  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  38.09 
 
 
664 aa  441  9.999999999999999e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  38.63 
 
 
667 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  38.69 
 
 
632 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  39.43 
 
 
655 aa  440  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  38.24 
 
 
664 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  37.58 
 
 
657 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  39.35 
 
 
657 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  36.97 
 
 
666 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  39.11 
 
 
657 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  40.43 
 
 
658 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  38.18 
 
 
661 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  37.31 
 
 
657 aa  433  1e-120  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2859  acetate--CoA ligase  38.4 
 
 
636 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  39.01 
 
 
643 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  38.38 
 
 
657 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1868  acetate/CoA ligase  40.5 
 
 
652 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.477544  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  37.76 
 
 
649 aa  433  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  37.46 
 
 
656 aa  434  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>