More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6450 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7333  AMP-dependent synthetase and ligase  51.41 
 
 		 650 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6450  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 650 aa  1321    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  hitchhiker  0.0000000000000110833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1821  AMP-dependent synthetase and ligase  50.16 
 
 		 652 aa  627  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1428  AMP-dependent synthetase and ligase  45.9 
 
 		 640 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922087  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6401  AMP-dependent synthetase and ligase  45.9 
 
 		 640 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2566  putative acetoacetyl-CoA synthase  40.38 
 
 		 646 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000120954 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2554  acetoacetyl-CoA synthase, putative  40.38 
 
 		 646 aa  497  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2333  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  40.38 
 
 		 646 aa  496  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2292  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  40.38 
 
 		 646 aa  497  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.365139  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2609  putative acetoacetyl-CoA synthase  40.22 
 
 		 646 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2517  putative acetoacetyl-CoA synthase  40.53 
 
 		 646 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2376  acetoacetyl-CoA synthase  40.38 
 
 		 646 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.381353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2553  acetoacetyl-CoA synthase  40.38 
 
 		 646 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2806  putative acetoacetyl-CoA synthase  40.53 
 
 		 646 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.846139  hitchhiker  0.00209693 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  41.93 
 
 		 642 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  40.06 
 
 		 646 aa  491  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  40.38 
 
 		 646 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0926585  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2222  AMP-dependent synthetase and ligase  41.46 
 
 		 641 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  39.91 
 
 		 663 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0770781  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2788  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 608 aa  425  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2113  AMP-dependent synthetase and ligase  39.56 
 
 		 643 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3467  AMP-dependent synthetase and ligase  39.57 
 
 		 670 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7155  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 		 668 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2583  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 674 aa  392  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319993  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 694 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2056  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 		 663 aa  387  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 		 608 aa  384  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0200095  normal  0.25307 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 670 aa  376  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0166  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 623 aa  375  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0866  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 641 aa  365  1e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0265876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  33.65 
 
 		 650 aa  333  6e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  33.49 
 
 		 670 aa  331  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  33.23 
 
 		 667 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  32.92 
 
 		 664 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  33.91 
 
 		 650 aa  327  6e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  33.23 
 
 		 666 aa  325  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  33.17 
 
 		 667 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  33.39 
 
 		 657 aa  324  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  33.12 
 
 		 667 aa  323  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  33.54 
 
 		 656 aa  323  7e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  32.76 
 
 		 653 aa  320  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  34.38 
 
 		 655 aa  320  7e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1381  acetate/CoA ligase  35.66 
 
 		 677 aa  319  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  32.97 
 
 		 660 aa  318  2e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  33.91 
 
 		 638 aa  317  4e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  34.65 
 
 		 654 aa  317  5e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  33.23 
 
 		 663 aa  316  7e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  33.99 
 
 		 649 aa  314  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  32.49 
 
 		 639 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  32.18 
 
 		 631 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  33.18 
 
 		 667 aa  313  9e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  35.43 
 
 		 654 aa  312  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  33.75 
 
 		 666 aa  311  2e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  32.58 
 
 		 639 aa  310  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  32.77 
 
 		 666 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  32.86 
 
 		 663 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19340  acetyl-coenzyme A synthetase  33.94 
 
 		 741 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.101237  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 636 aa  307  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  33.44 
 
 		 646 aa  307  4.0000000000000004e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  34.88 
 
 		 649 aa  306  7e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  34.17 
 
 		 674 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  33.23 
 
 		 652 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  33.22 
 
 		 638 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  33.85 
 
 		 668 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  35.21 
 
 		 661 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  32.82 
 
 		 631 aa  303  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  33.84 
 
 		 715 aa  302  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  33.17 
 
 		 655 aa  302  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  33.59 
 
 		 658 aa  302  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  33.6 
 
 		 666 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  30.9 
 
 		 636 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  32.55 
 
 		 632 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  33.44 
 
 		 660 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  33.44 
 
 		 660 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  32.39 
 
 		 632 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  30.74 
 
 		 636 aa  300  6e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  32.86 
 
 		 660 aa  299  9e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  32.27 
 
 		 643 aa  299  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  31.18 
 
 		 626 aa  299  1e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  33.49 
 
 		 657 aa  298  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  34.07 
 
 		 651 aa  298  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  34.07 
 
 		 656 aa  298  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  32.32 
 
 		 648 aa  298  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  33.13 
 
 		 657 aa  297  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  32.39 
 
 		 664 aa  298  3e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  34.84 
 
 		 659 aa  297  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  33.87 
 
 		 670 aa  297  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1301  transcriptional regulator, IclR family  32.34 
 
 		 880 aa  296  6e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203526 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  33.33 
 
 		 658 aa  295  1e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  32.44 
 
 		 656 aa  295  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  31.74 
 
 		 656 aa  295  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  34.93 
 
 		 653 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  33.7 
 
 		 663 aa  296  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  30.46 
 
 		 636 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3790  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 633 aa  294  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.20899  decreased coverage  0.0016859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  33.18 
 
 		 661 aa  293  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  32.17 
 
 		 659 aa  293  5e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  31.42 
 
 		 666 aa  293  6e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  33.81 
 
 		 670 aa  293  7e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  32.24 
 
 		 629 aa  293  7e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>