More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0779 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1610  acetoacetyl-CoA synthase  50.85 
 
 
651 aa  677    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.787437  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1247  acetoacetyl-CoA synthase  50.62 
 
 
651 aa  686    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.916706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3071  acetoacetyl-CoA synthetase  49.61 
 
 
650 aa  672    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.922751  normal  0.501607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3297  acetoacetyl-CoA synthetase  51.31 
 
 
651 aa  701    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0021  acetoacetyl-CoA synthetase  48.92 
 
 
662 aa  671    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1794  acetoacetyl-CoA synthetase  51.17 
 
 
646 aa  698    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1795  acetoacetyl-CoA synthetase  50.7 
 
 
646 aa  694    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0177  acetoacetyl-CoA synthetase  49.69 
 
 
651 aa  684    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2653  acetoacetyl-CoA synthetase  49.3 
 
 
650 aa  661    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0554  acetoacetyl-CoA synthase  50.23 
 
 
658 aa  691    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2047  acetoacetyl-CoA synthetase  56.5 
 
 
651 aa  766    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3080  acetoacetyl-CoA synthetase  49 
 
 
651 aa  663    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2720  acetoacetyl-CoA synthetase  50.31 
 
 
653 aa  682    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.0612564 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3695  acetoacetyl-CoA synthetase  47.35 
 
 
668 aa  636    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506313  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0018  acetoacetyl-CoA synthetase  48.76 
 
 
662 aa  671    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677245  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3889  acetoacetyl-CoA synthase  48.09 
 
 
653 aa  670    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00052085  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0380  acetoacetyl-CoA synthetase  48.38 
 
 
650 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044282 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0036  acetoacetyl-CoA synthetase  47.77 
 
 
662 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1658  acetoacetyl-CoA synthetase  49.7 
 
 
662 aa  654    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0315  acetoacetyl-CoA synthetase  49.17 
 
 
650 aa  660    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1820  acetoacetyl-CoA synthetase  49 
 
 
649 aa  665    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000185409  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4886  acetoacetyl-CoA synthase  54.7 
 
 
657 aa  748    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0168  acetoacetyl-CoA synthetase  48.39 
 
 
652 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38690  acetoacetyl-CoA synthetase  51.47 
 
 
651 aa  702    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2795  acetoacetyl-CoA synthetase  49.3 
 
 
652 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  0.10488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2028  acetoacetyl-CoA synthetase  51.54 
 
 
651 aa  696    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720983  normal  0.488067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0412  acetoacetyl-CoA synthetase  48.17 
 
 
650 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0370757  hitchhiker  0.0000659795 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0779  acetoacetyl-CoA synthetase  100 
 
 
650 aa  1349    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1185  acetoacetyl-CoA synthetase  99.38 
 
 
650 aa  1340    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2108  acetoacetyl-CoA synthetase  47.15 
 
 
651 aa  634  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.188473 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05420  acetoacetyl-CoA synthetase  44.51 
 
 
656 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001479  acetoacetyl-CoA synthetase  44.73 
 
 
657 aa  601  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.525178  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0406  acetoacetyl-CoA synthetase  45.14 
 
 
659 aa  598  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000302212  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000409  acetoacetyl-CoA synthetase  43.65 
 
 
695 aa  585  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1714  acetoacetyl-CoA synthetase  42.99 
 
 
687 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.776218  normal  0.102104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0089  acetoacetyl-CoA synthetase  44.1 
 
 
662 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3829  acetoacetyl-CoA synthetase  43.57 
 
 
657 aa  567  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1953  acetoacetyl-CoA synthetase  43.72 
 
 
657 aa  560  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2342  acetoacetyl-CoA synthetase  44.01 
 
 
660 aa  551  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2277  acetoacetyl-CoA synthetase  41.71 
 
 
667 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3294  acetoacetyl-CoA synthetase  42.16 
 
 
676 aa  551  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1970  acetoacetyl-CoA synthetase  41.71 
 
 
676 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0246  acetoacetyl-CoA synthetase  43.01 
 
 
661 aa  542  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3920  acetoacetyl-CoA synthase  42.64 
 
 
649 aa  539  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0006  acetoacetyl-CoA synthetase  44.6 
 
 
646 aa  538  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.497617  normal  0.392863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4421  acetoacetyl-CoA synthase  42.55 
 
 
656 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0788  acetoacetyl-CoA synthase  43.39 
 
 
645 aa  534  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2192  acetoacetyl-CoA synthetase  41.2 
 
 
669 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175358  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2245  acetoacetyl-CoA synthetase  43.46 
 
 
654 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115691  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0764  acetoacetyl-CoA synthetase  40.56 
 
 
671 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839024  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2699  acetoacetyl-CoA synthetase  40.25 
 
 
669 aa  525  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4892  acetoacetyl-CoA synthase  40.52 
 
 
666 aa  519  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1154  acetoacetyl-CoA synthetase  40.68 
 
 
666 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal  0.586098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3504  acetoacetyl-CoA synthetase  40.03 
 
 
709 aa  521  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.315612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0879  acetoacetyl-CoA synthetase  41.4 
 
 
664 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.361725  normal  0.0726893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1444  acetyl-CoA synthetase  39.65 
 
 
681 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1569  acetoacetyl-CoA synthetase  41.06 
 
 
664 aa  512  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504924  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2133  acetoacetyl-CoA synthase  41.28 
 
 
667 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569736  decreased coverage  0.00936242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4014  acetoacetyl-CoA synthase  40.92 
 
 
667 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3253  acetoacetyl-CoA synthase  39.29 
 
 
685 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0699  acetoacetyl-CoA synthetase  40.4 
 
 
684 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0880431  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0655  acetoacetyl-CoA synthetase  40.25 
 
 
684 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0662658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2270  acetoacetyl-CoA synthase  40.55 
 
 
654 aa  508  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4482  acetoacetyl-CoA synthase  41.27 
 
 
662 aa  499  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.984378  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0937  acetoacetyl-CoA synthetase  41.1 
 
 
665 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3863  acetoacetyl-CoA synthase  39.63 
 
 
669 aa  498  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556445  normal  0.0884622 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6018  acetoacetyl-CoA synthase  40.77 
 
 
667 aa  497  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0152  acetoacetyl-CoA synthase  41.14 
 
 
651 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0304  acetoacetyl-CoA synthase  39.11 
 
 
667 aa  494  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4181  acetoacetyl-CoA synthase  38.19 
 
 
646 aa  491  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.166817  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5085  acetoacetyl-CoA synthetase  38.7 
 
 
643 aa  492  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293812  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4700  acetoacetyl-CoA synthetase  38.7 
 
 
643 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4786  acetoacetyl-CoA synthetase  38.7 
 
 
643 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434813  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1209  acetoacetyl-CoA synthetase  38.92 
 
 
665 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926672  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01880  acetoacetyl-CoA synthase  39.26 
 
 
673 aa  481  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1473  acetoacetyl-CoA synthetase  37.4 
 
 
637 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598373  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5298  acetoacetyl-CoA synthetase  39 
 
 
632 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150351 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01103  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_1G11880)  39.79 
 
 
690 aa  468  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0087  acetoacetyl-CoA synthetase  37.69 
 
 
704 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.387097  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1363  acetoacetyl-CoA synthase  39.17 
 
 
654 aa  442  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3179  acetoacetyl-CoA synthetase  37.92 
 
 
695 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0119  acetoacetyl-CoA synthetase  37.08 
 
 
727 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04900  conserved hypothetical protein  38.25 
 
 
698 aa  426  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0107  acetoacetyl-CoA synthetase  36.97 
 
 
671 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.924378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3315  acetoacetyl-CoA synthase  37.86 
 
 
620 aa  425  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3963  acetoacetyl-CoA synthetase  34.84 
 
 
711 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191797  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0074  acetoacetyl-CoA synthetase  36.03 
 
 
695 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0120  acetoacetyl-CoA synthetase  36.43 
 
 
696 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.666374  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1149  acetoacetyl-CoA synthase  34.65 
 
 
654 aa  412  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.335784  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7003  acetoacetyl-CoA synthase  36.6 
 
 
1056 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2019  acetoacetyl-CoA synthase  35.64 
 
 
658 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000482159  normal  0.0114668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4720  acetoacetyl-CoA synthase  34.51 
 
 
1021 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0916  acetoacetyl-CoA synthase  35.74 
 
 
971 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0443  acetoacetyl-CoA synthase  37.46 
 
 
988 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303442  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0054  acetoacetyl-CoA synthetase  32.03 
 
 
754 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 
568 aa  355  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280007 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01482  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_8G04770)  33.19 
 
 
698 aa  350  5e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 
670 aa  280  7e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 
642 aa  276  9e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2583  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 
674 aa  273  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>