More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1953 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1154  acetoacetyl-CoA synthetase  51.45 
 
 		 666 aa  684    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal  0.586098 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0304  acetoacetyl-CoA synthase  54.95 
 
 		 667 aa  707    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0246  acetoacetyl-CoA synthetase  59.17 
 
 		 661 aa  803    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2277  acetoacetyl-CoA synthetase  57.36 
 
 		 667 aa  796    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3829  acetoacetyl-CoA synthetase  86 
 
 		 657 aa  1159    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4421  acetoacetyl-CoA synthase  52.28 
 
 		 656 aa  734    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2245  acetoacetyl-CoA synthetase  58.1 
 
 		 654 aa  723    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1970  acetoacetyl-CoA synthetase  56.47 
 
 		 676 aa  807    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129339  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0764  acetoacetyl-CoA synthetase  55.86 
 
 		 671 aa  771    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839024  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0655  acetoacetyl-CoA synthetase  56.54 
 
 		 684 aa  742    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0662658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4482  acetoacetyl-CoA synthase  58.22 
 
 		 662 aa  739    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.984378  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1209  acetoacetyl-CoA synthetase  51.04 
 
 		 665 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1444  acetyl-CoA synthetase  53.72 
 
 		 681 aa  701    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4014  acetoacetyl-CoA synthase  57.43 
 
 		 667 aa  731    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3504  acetoacetyl-CoA synthetase  54.74 
 
 		 709 aa  678    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.315612 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3963  acetoacetyl-CoA synthetase  49.14 
 
 		 711 aa  638    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0120  acetoacetyl-CoA synthetase  51.33 
 
 		 696 aa  659    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.666374  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01880  acetoacetyl-CoA synthase  54.99 
 
 		 673 aa  719    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1953  acetoacetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 657 aa  1337    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2699  acetoacetyl-CoA synthetase  55.59 
 
 		 669 aa  758    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0087  acetoacetyl-CoA synthetase  51.81 
 
 		 704 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.387097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2270  acetoacetyl-CoA synthase  53.61 
 
 		 654 aa  716    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0699  acetoacetyl-CoA synthetase  56.39 
 
 		 684 aa  736    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0880431  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0937  acetoacetyl-CoA synthetase  58.59 
 
 		 665 aa  731    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4700  acetoacetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 		 643 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3920  acetoacetyl-CoA synthase  50.39 
 
 		 649 aa  702    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3253  acetoacetyl-CoA synthase  54.15 
 
 		 685 aa  709    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1569  acetoacetyl-CoA synthetase  53.67 
 
 		 664 aa  688    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2342  acetoacetyl-CoA synthetase  60.18 
 
 		 660 aa  813    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0879  acetoacetyl-CoA synthetase  58.9 
 
 		 664 aa  748    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.361725  normal  0.0726893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4892  acetoacetyl-CoA synthase  51.67 
 
 		 666 aa  684    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6018  acetoacetyl-CoA synthase  56.09 
 
 		 667 aa  733    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0074  acetoacetyl-CoA synthetase  52.52 
 
 		 695 aa  671    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0152  acetoacetyl-CoA synthase  55.71 
 
 		 651 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0107  acetoacetyl-CoA synthetase  51.13 
 
 		 671 aa  659    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.924378  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0788  acetoacetyl-CoA synthase  57.38 
 
 		 645 aa  724    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3863  acetoacetyl-CoA synthase  52.72 
 
 		 669 aa  677    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556445  normal  0.0884622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4786  acetoacetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 		 643 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2192  acetoacetyl-CoA synthetase  56.75 
 
 		 669 aa  751    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5085  acetoacetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 		 643 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293812  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0119  acetoacetyl-CoA synthetase  52.54 
 
 		 727 aa  668    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2133  acetoacetyl-CoA synthase  51.07 
 
 		 667 aa  697    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569736  decreased coverage  0.00936242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3179  acetoacetyl-CoA synthetase  52.85 
 
 		 695 aa  656    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1473  acetoacetyl-CoA synthetase  48.58 
 
 		 637 aa  624  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1247  acetoacetyl-CoA synthase  50.31 
 
 		 651 aa  622  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.916706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2108  acetoacetyl-CoA synthetase  49.31 
 
 		 651 aa  613  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188473 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1820  acetoacetyl-CoA synthetase  48.61 
 
 		 649 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000185409  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5298  acetoacetyl-CoA synthetase  47.6 
 
 		 632 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1610  acetoacetyl-CoA synthase  45.37 
 
 		 651 aa  600  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.787437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38690  acetoacetyl-CoA synthetase  47.99 
 
 		 651 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3297  acetoacetyl-CoA synthetase  47.38 
 
 		 651 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0089  acetoacetyl-CoA synthetase  44.7 
 
 		 662 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848036  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2047  acetoacetyl-CoA synthetase  46.58 
 
 		 651 aa  568  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0554  acetoacetyl-CoA synthase  45.99 
 
 		 658 aa  564  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3080  acetoacetyl-CoA synthetase  44.58 
 
 		 651 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2795  acetoacetyl-CoA synthetase  45.2 
 
 		 652 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  0.10488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0168  acetoacetyl-CoA synthetase  45.51 
 
 		 652 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2028  acetoacetyl-CoA synthetase  46.21 
 
 		 651 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720983  normal  0.488067 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0177  acetoacetyl-CoA synthetase  45.06 
 
 		 651 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0779  acetoacetyl-CoA synthetase  43.72 
 
 		 650 aa  560  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1185  acetoacetyl-CoA synthetase  43.88 
 
 		 650 aa  561  1e-158  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4886  acetoacetyl-CoA synthase  41.47 
 
 		 657 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3071  acetoacetyl-CoA synthetase  44.77 
 
 		 650 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.922751  normal  0.501607 
 
 
-
 
NC_004310  BR0021  acetoacetyl-CoA synthetase  45.01 
 
 		 662 aa  557  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1794  acetoacetyl-CoA synthetase  42.79 
 
 		 646 aa  558  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0018  acetoacetyl-CoA synthetase  44.85 
 
 		 662 aa  556  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677245  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2720  acetoacetyl-CoA synthetase  43.96 
 
 		 653 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.0612564 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1795  acetoacetyl-CoA synthetase  42.48 
 
 		 646 aa  548  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1363  acetoacetyl-CoA synthase  46.83 
 
 		 654 aa  550  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0036  acetoacetyl-CoA synthetase  44.2 
 
 		 662 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2653  acetoacetyl-CoA synthetase  44.77 
 
 		 650 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3695  acetoacetyl-CoA synthetase  46.05 
 
 		 668 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506313  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0315  acetoacetyl-CoA synthetase  43.98 
 
 		 650 aa  532  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3315  acetoacetyl-CoA synthase  44.71 
 
 		 620 aa  532  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3889  acetoacetyl-CoA synthase  45.31 
 
 		 653 aa  528  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00052085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1149  acetoacetyl-CoA synthase  45.43 
 
 		 654 aa  523  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.335784  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2019  acetoacetyl-CoA synthase  45.74 
 
 		 658 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000482159  normal  0.0114668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0412  acetoacetyl-CoA synthetase  43.89 
 
 		 650 aa  521  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0370757  hitchhiker  0.0000659795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0380  acetoacetyl-CoA synthetase  43.19 
 
 		 650 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1658  acetoacetyl-CoA synthetase  46.36 
 
 		 662 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1714  acetoacetyl-CoA synthetase  43.97 
 
 		 687 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.776218  normal  0.102104 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001479  acetoacetyl-CoA synthetase  40.33 
 
 		 657 aa  502  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.525178  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000409  acetoacetyl-CoA synthetase  40.15 
 
 		 695 aa  500  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0406  acetoacetyl-CoA synthetase  40.09 
 
 		 659 aa  490  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000302212  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05420  acetoacetyl-CoA synthetase  39.09 
 
 		 656 aa  490  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3294  acetoacetyl-CoA synthetase  40.53 
 
 		 676 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  46.46 
 
 		 568 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0006  acetoacetyl-CoA synthetase  37.37 
 
 		 646 aa  442  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.497617  normal  0.392863 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01103  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_1G11880)  38.77 
 
 		 690 aa  426  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4181  acetoacetyl-CoA synthase  36.88 
 
 		 646 aa  428  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.166817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0054  acetoacetyl-CoA synthetase  50.86 
 
 		 754 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4720  acetoacetyl-CoA synthase  38.21 
 
 		 1021 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04900  conserved hypothetical protein  35.63 
 
 		 698 aa  389  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0916  acetoacetyl-CoA synthase  38.63 
 
 		 971 aa  379  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7003  acetoacetyl-CoA synthase  37.79 
 
 		 1056 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0443  acetoacetyl-CoA synthase  38.55 
 
 		 988 aa  348  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303442  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01482  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_8G04770)  33.58 
 
 		 698 aa  348  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 642 aa  296  8e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2222  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 		 641 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 670 aa  277  5e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>