More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4014 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_01880  acetoacetyl-CoA synthase  55.37 
 
 
673 aa  686    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3253  acetoacetyl-CoA synthase  51.48 
 
 
685 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4482  acetoacetyl-CoA synthase  54.06 
 
 
662 aa  654    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.984378  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1444  acetyl-CoA synthetase  66.47 
 
 
681 aa  865    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0764  acetoacetyl-CoA synthetase  53.19 
 
 
671 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4892  acetoacetyl-CoA synthase  50.99 
 
 
666 aa  638    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0152  acetoacetyl-CoA synthase  56.15 
 
 
651 aa  643    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4421  acetoacetyl-CoA synthase  50.15 
 
 
656 aa  636    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1970  acetoacetyl-CoA synthetase  53.89 
 
 
676 aa  738    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0246  acetoacetyl-CoA synthetase  56.31 
 
 
661 aa  719    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6018  acetoacetyl-CoA synthase  54.01 
 
 
667 aa  655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3504  acetoacetyl-CoA synthetase  52.44 
 
 
709 aa  639    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.315612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0788  acetoacetyl-CoA synthase  70.43 
 
 
645 aa  889    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1953  acetoacetyl-CoA synthetase  57.43 
 
 
657 aa  731    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2699  acetoacetyl-CoA synthetase  53.41 
 
 
669 aa  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0879  acetoacetyl-CoA synthetase  60.4 
 
 
664 aa  738    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.361725  normal  0.0726893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0937  acetoacetyl-CoA synthetase  59.63 
 
 
665 aa  712    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2192  acetoacetyl-CoA synthetase  51.79 
 
 
669 aa  645    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175358  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1569  acetoacetyl-CoA synthetase  53.22 
 
 
664 aa  640    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2342  acetoacetyl-CoA synthetase  56.45 
 
 
660 aa  704    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3863  acetoacetyl-CoA synthase  52.44 
 
 
669 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556445  normal  0.0884622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3829  acetoacetyl-CoA synthetase  58.35 
 
 
657 aa  750    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0304  acetoacetyl-CoA synthase  52.92 
 
 
667 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0655  acetoacetyl-CoA synthetase  50.83 
 
 
684 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0662658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4014  acetoacetyl-CoA synthase  100 
 
 
667 aa  1332    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2277  acetoacetyl-CoA synthetase  55.35 
 
 
667 aa  741    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0699  acetoacetyl-CoA synthetase  50.98 
 
 
684 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0880431  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3920  acetoacetyl-CoA synthase  48.55 
 
 
649 aa  633  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1209  acetoacetyl-CoA synthetase  51.13 
 
 
665 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926672  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2245  acetoacetyl-CoA synthetase  51.38 
 
 
654 aa  620  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1154  acetoacetyl-CoA synthetase  48.02 
 
 
666 aa  617  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal  0.586098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2270  acetoacetyl-CoA synthase  49.69 
 
 
654 aa  612  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2133  acetoacetyl-CoA synthase  47.81 
 
 
667 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569736  decreased coverage  0.00936242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0119  acetoacetyl-CoA synthetase  50 
 
 
727 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0087  acetoacetyl-CoA synthetase  49.55 
 
 
704 aa  605  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.387097  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3179  acetoacetyl-CoA synthetase  50.07 
 
 
695 aa  595  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0177  acetoacetyl-CoA synthetase  47.34 
 
 
651 aa  588  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0074  acetoacetyl-CoA synthetase  49.13 
 
 
695 aa  588  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0107  acetoacetyl-CoA synthetase  49.01 
 
 
671 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.924378  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3963  acetoacetyl-CoA synthetase  47.05 
 
 
711 aa  580  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0120  acetoacetyl-CoA synthetase  47.96 
 
 
696 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.666374  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1820  acetoacetyl-CoA synthetase  47 
 
 
649 aa  570  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000185409  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4700  acetoacetyl-CoA synthetase  46.83 
 
 
643 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5085  acetoacetyl-CoA synthetase  46.83 
 
 
643 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293812  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4786  acetoacetyl-CoA synthetase  46.83 
 
 
643 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434813  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2108  acetoacetyl-CoA synthetase  47.55 
 
 
651 aa  561  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.188473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2047  acetoacetyl-CoA synthetase  47.31 
 
 
651 aa  558  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5298  acetoacetyl-CoA synthetase  46.59 
 
 
632 aa  555  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1610  acetoacetyl-CoA synthase  44.72 
 
 
651 aa  549  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.787437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1473  acetoacetyl-CoA synthetase  44.82 
 
 
637 aa  545  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598373  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3695  acetoacetyl-CoA synthetase  47.16 
 
 
668 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0021  acetoacetyl-CoA synthetase  45.18 
 
 
662 aa  543  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38690  acetoacetyl-CoA synthetase  47.02 
 
 
651 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3297  acetoacetyl-CoA synthetase  46.79 
 
 
651 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0018  acetoacetyl-CoA synthetase  45.18 
 
 
662 aa  541  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677245  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3889  acetoacetyl-CoA synthase  46.67 
 
 
653 aa  539  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00052085  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1247  acetoacetyl-CoA synthase  45.18 
 
 
651 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.916706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0036  acetoacetyl-CoA synthetase  45.62 
 
 
662 aa  538  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0168  acetoacetyl-CoA synthetase  45.5 
 
 
652 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1794  acetoacetyl-CoA synthetase  42.53 
 
 
646 aa  534  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3080  acetoacetyl-CoA synthetase  43.95 
 
 
651 aa  535  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1149  acetoacetyl-CoA synthase  46.33 
 
 
654 aa  534  1e-150  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.335784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2028  acetoacetyl-CoA synthetase  45.55 
 
 
651 aa  531  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720983  normal  0.488067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2795  acetoacetyl-CoA synthetase  44.55 
 
 
652 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  0.10488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2720  acetoacetyl-CoA synthetase  44.1 
 
 
653 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.0612564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3071  acetoacetyl-CoA synthetase  45.01 
 
 
650 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.922751  normal  0.501607 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1795  acetoacetyl-CoA synthetase  43.6 
 
 
646 aa  525  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0089  acetoacetyl-CoA synthetase  44.05 
 
 
662 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848036  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0315  acetoacetyl-CoA synthetase  44.53 
 
 
650 aa  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2653  acetoacetyl-CoA synthetase  45.09 
 
 
650 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2019  acetoacetyl-CoA synthase  46.69 
 
 
658 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000482159  normal  0.0114668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1658  acetoacetyl-CoA synthetase  45.43 
 
 
662 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1185  acetoacetyl-CoA synthetase  41.23 
 
 
650 aa  511  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0779  acetoacetyl-CoA synthetase  40.92 
 
 
650 aa  509  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4886  acetoacetyl-CoA synthase  40.24 
 
 
657 aa  512  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000409  acetoacetyl-CoA synthetase  40.63 
 
 
695 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05420  acetoacetyl-CoA synthetase  40.88 
 
 
656 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0554  acetoacetyl-CoA synthase  43.88 
 
 
658 aa  504  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1363  acetoacetyl-CoA synthase  46.25 
 
 
654 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0380  acetoacetyl-CoA synthetase  43.57 
 
 
650 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044282 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0406  acetoacetyl-CoA synthetase  41.92 
 
 
659 aa  498  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000302212  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0412  acetoacetyl-CoA synthetase  43.19 
 
 
650 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0370757  hitchhiker  0.0000659795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3315  acetoacetyl-CoA synthase  44.34 
 
 
620 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001479  acetoacetyl-CoA synthetase  38.74 
 
 
657 aa  485  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.525178  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1714  acetoacetyl-CoA synthetase  44.24 
 
 
687 aa  484  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.776218  normal  0.102104 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3294  acetoacetyl-CoA synthetase  41.36 
 
 
676 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4181  acetoacetyl-CoA synthase  37.14 
 
 
646 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.166817  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01103  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_1G11880)  37.9 
 
 
690 aa  424  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04900  conserved hypothetical protein  38.72 
 
 
698 aa  416  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  45.08 
 
 
568 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0006  acetoacetyl-CoA synthetase  36.75 
 
 
646 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.497617  normal  0.392863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4720  acetoacetyl-CoA synthase  36.73 
 
 
1021 aa  356  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0916  acetoacetyl-CoA synthase  39.33 
 
 
971 aa  355  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01482  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_8G04770)  34.45 
 
 
698 aa  351  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7003  acetoacetyl-CoA synthase  36.45 
 
 
1056 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0443  acetoacetyl-CoA synthase  40.82 
 
 
988 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303442  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0054  acetoacetyl-CoA synthetase  46.65 
 
 
754 aa  337  5.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 
642 aa  291  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 
663 aa  273  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0770781  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 
670 aa  269  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>