More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2133 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0699  acetoacetyl-CoA synthetase  50.83 
 
 		 684 aa  661    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0880431  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0788  acetoacetyl-CoA synthase  50.92 
 
 		 645 aa  637    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0764  acetoacetyl-CoA synthetase  52.52 
 
 		 671 aa  714    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4421  acetoacetyl-CoA synthase  47.7 
 
 		 656 aa  655    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1209  acetoacetyl-CoA synthetase  48.71 
 
 		 665 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0107  acetoacetyl-CoA synthetase  49.54 
 
 		 671 aa  651    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.924378  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2270  acetoacetyl-CoA synthase  63.68 
 
 		 654 aa  864    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3920  acetoacetyl-CoA synthase  46.62 
 
 		 649 aa  641    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1953  acetoacetyl-CoA synthetase  51.07 
 
 		 657 aa  697    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2699  acetoacetyl-CoA synthetase  53.07 
 
 		 669 aa  722    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0655  acetoacetyl-CoA synthetase  50.9 
 
 		 684 aa  662    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0662658 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3253  acetoacetyl-CoA synthase  49.42 
 
 		 685 aa  650    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2342  acetoacetyl-CoA synthetase  50.84 
 
 		 660 aa  660    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4482  acetoacetyl-CoA synthase  50.77 
 
 		 662 aa  648    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.984378  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0246  acetoacetyl-CoA synthetase  49.39 
 
 		 661 aa  669    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3829  acetoacetyl-CoA synthetase  51.76 
 
 		 657 aa  710    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1970  acetoacetyl-CoA synthetase  52.92 
 
 		 676 aa  742    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2277  acetoacetyl-CoA synthetase  52.91 
 
 		 667 aa  738    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2133  acetoacetyl-CoA synthase  100 
 
 		 667 aa  1379    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569736  decreased coverage  0.00936242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0074  acetoacetyl-CoA synthetase  48.52 
 
 		 695 aa  630  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2245  acetoacetyl-CoA synthetase  49.69 
 
 		 654 aa  629  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1154  acetoacetyl-CoA synthetase  45.64 
 
 		 666 aa  628  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal  0.586098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2192  acetoacetyl-CoA synthetase  46.94 
 
 		 669 aa  623  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4892  acetoacetyl-CoA synthase  47.79 
 
 		 666 aa  622  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0087  acetoacetyl-CoA synthetase  49.17 
 
 		 704 aa  623  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.387097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0879  acetoacetyl-CoA synthetase  48.77 
 
 		 664 aa  616  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.361725  normal  0.0726893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4014  acetoacetyl-CoA synthase  47.81 
 
 		 667 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3963  acetoacetyl-CoA synthetase  45.95 
 
 		 711 aa  611  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0120  acetoacetyl-CoA synthetase  46.31 
 
 		 696 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.666374  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3179  acetoacetyl-CoA synthetase  46.61 
 
 		 695 aa  609  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1569  acetoacetyl-CoA synthetase  48.06 
 
 		 664 aa  606  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504924  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0937  acetoacetyl-CoA synthetase  48.56 
 
 		 665 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0119  acetoacetyl-CoA synthetase  46.88 
 
 		 727 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0152  acetoacetyl-CoA synthase  48.85 
 
 		 651 aa  604  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1444  acetyl-CoA synthetase  45.91 
 
 		 681 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3504  acetoacetyl-CoA synthetase  46.4 
 
 		 709 aa  594  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.315612 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4700  acetoacetyl-CoA synthetase  46.26 
 
 		 643 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5085  acetoacetyl-CoA synthetase  46.26 
 
 		 643 aa  595  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293812  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4786  acetoacetyl-CoA synthetase  46.26 
 
 		 643 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01880  acetoacetyl-CoA synthase  45.8 
 
 		 673 aa  590  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1473  acetoacetyl-CoA synthetase  44.44 
 
 		 637 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6018  acetoacetyl-CoA synthase  45.3 
 
 		 667 aa  568  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0054  acetoacetyl-CoA synthetase  43.05 
 
 		 754 aa  565  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5298  acetoacetyl-CoA synthetase  44.69 
 
 		 632 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2108  acetoacetyl-CoA synthetase  45.48 
 
 		 651 aa  560  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0304  acetoacetyl-CoA synthase  44.09 
 
 		 667 aa  549  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3863  acetoacetyl-CoA synthase  43.78 
 
 		 669 aa  545  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556445  normal  0.0884622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2028  acetoacetyl-CoA synthetase  43.96 
 
 		 651 aa  548  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720983  normal  0.488067 
 
 
-
 
NC_004310  BR0021  acetoacetyl-CoA synthetase  43.88 
 
 		 662 aa  542  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0018  acetoacetyl-CoA synthetase  43.88 
 
 		 662 aa  541  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3297  acetoacetyl-CoA synthetase  43.88 
 
 		 651 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38690  acetoacetyl-CoA synthetase  43.8 
 
 		 651 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2019  acetoacetyl-CoA synthase  44.68 
 
 		 658 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000482159  normal  0.0114668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2720  acetoacetyl-CoA synthetase  43.43 
 
 		 653 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.0612564 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1820  acetoacetyl-CoA synthetase  42.86 
 
 		 649 aa  533  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000185409  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1247  acetoacetyl-CoA synthase  43.47 
 
 		 651 aa  533  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.916706  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1610  acetoacetyl-CoA synthase  40.83 
 
 		 651 aa  531  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.787437  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0036  acetoacetyl-CoA synthetase  42.77 
 
 		 662 aa  531  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0554  acetoacetyl-CoA synthase  42.92 
 
 		 658 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0089  acetoacetyl-CoA synthetase  43.01 
 
 		 662 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3080  acetoacetyl-CoA synthetase  42.17 
 
 		 651 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3695  acetoacetyl-CoA synthetase  43.19 
 
 		 668 aa  525  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0177  acetoacetyl-CoA synthetase  43.5 
 
 		 651 aa  519  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3889  acetoacetyl-CoA synthase  43.97 
 
 		 653 aa  520  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00052085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3071  acetoacetyl-CoA synthetase  42.55 
 
 		 650 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.922751  normal  0.501607 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2047  acetoacetyl-CoA synthetase  44.1 
 
 		 651 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2653  acetoacetyl-CoA synthetase  43.16 
 
 		 650 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2795  acetoacetyl-CoA synthetase  42.57 
 
 		 652 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  0.10488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4886  acetoacetyl-CoA synthase  38.62 
 
 		 657 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1185  acetoacetyl-CoA synthetase  41.43 
 
 		 650 aa  511  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0779  acetoacetyl-CoA synthetase  41.28 
 
 		 650 aa  509  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0168  acetoacetyl-CoA synthetase  42.08 
 
 		 652 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1794  acetoacetyl-CoA synthetase  41.28 
 
 		 646 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1795  acetoacetyl-CoA synthetase  40.78 
 
 		 646 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0315  acetoacetyl-CoA synthetase  42.68 
 
 		 650 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1363  acetoacetyl-CoA synthase  41.52 
 
 		 654 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1658  acetoacetyl-CoA synthetase  43.05 
 
 		 662 aa  488  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0412  acetoacetyl-CoA synthetase  40.7 
 
 		 650 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0370757  hitchhiker  0.0000659795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0380  acetoacetyl-CoA synthetase  40.67 
 
 		 650 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044282 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0406  acetoacetyl-CoA synthetase  39.45 
 
 		 659 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000302212  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1149  acetoacetyl-CoA synthase  41.56 
 
 		 654 aa  464  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.335784  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1714  acetoacetyl-CoA synthetase  40.92 
 
 		 687 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.776218  normal  0.102104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3315  acetoacetyl-CoA synthase  39.3 
 
 		 620 aa  460  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3294  acetoacetyl-CoA synthetase  40.28 
 
 		 676 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001479  acetoacetyl-CoA synthetase  37.06 
 
 		 657 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.525178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4181  acetoacetyl-CoA synthase  36.64 
 
 		 646 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.166817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000409  acetoacetyl-CoA synthetase  34.84 
 
 		 695 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0006  acetoacetyl-CoA synthetase  36.29 
 
 		 646 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.497617  normal  0.392863 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05420  acetoacetyl-CoA synthetase  34.71 
 
 		 656 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01103  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_1G11880)  37 
 
 		 690 aa  405  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  39.44 
 
 		 568 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280007 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4720  acetoacetyl-CoA synthase  37.98 
 
 		 1021 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7003  acetoacetyl-CoA synthase  36.38 
 
 		 1056 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0916  acetoacetyl-CoA synthase  37.04 
 
 		 971 aa  357  5e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01482  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_8G04770)  32.95 
 
 		 698 aa  349  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04900  conserved hypothetical protein  33.76 
 
 		 698 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0443  acetoacetyl-CoA synthase  37.58 
 
 		 988 aa  334  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303442  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 		 642 aa  275  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 		 646 aa  269  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 		 670 aa  268  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>