More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2720 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3071  acetoacetyl-CoA synthetase  86.29 
 
 		 650 aa  1141    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.922751  normal  0.501607 
 
 
-
 
NC_004310  BR0021  acetoacetyl-CoA synthetase  56.31 
 
 		 662 aa  733    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1794  acetoacetyl-CoA synthetase  53.93 
 
 		 646 aa  749    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1795  acetoacetyl-CoA synthetase  52.85 
 
 		 646 aa  735    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0177  acetoacetyl-CoA synthetase  55.85 
 
 		 651 aa  717    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3297  acetoacetyl-CoA synthetase  71.63 
 
 		 651 aa  987    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2047  acetoacetyl-CoA synthetase  58.19 
 
 		 651 aa  767    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3080  acetoacetyl-CoA synthetase  69.54 
 
 		 651 aa  951    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3889  acetoacetyl-CoA synthase  54.66 
 
 		 653 aa  702    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00052085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3695  acetoacetyl-CoA synthetase  54.07 
 
 		 668 aa  676    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506313  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2720  acetoacetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 653 aa  1351    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.0612564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2028  acetoacetyl-CoA synthetase  70.77 
 
 		 651 aa  973    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720983  normal  0.488067 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0315  acetoacetyl-CoA synthetase  56.25 
 
 		 650 aa  702    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0018  acetoacetyl-CoA synthetase  56.15 
 
 		 662 aa  732    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677245  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0779  acetoacetyl-CoA synthetase  50.31 
 
 		 650 aa  682    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1820  acetoacetyl-CoA synthetase  57.3 
 
 		 649 aa  759    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000185409  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1247  acetoacetyl-CoA synthase  52.31 
 
 		 651 aa  680    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.916706  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0380  acetoacetyl-CoA synthetase  56.33 
 
 		 650 aa  696    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2795  acetoacetyl-CoA synthetase  85.6 
 
 		 652 aa  1139    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  0.10488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0554  acetoacetyl-CoA synthase  56.08 
 
 		 658 aa  731    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0168  acetoacetyl-CoA synthetase  55.04 
 
 		 652 aa  707    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1610  acetoacetyl-CoA synthase  51.23 
 
 		 651 aa  683    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.787437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38690  acetoacetyl-CoA synthetase  71.16 
 
 		 651 aa  982    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0412  acetoacetyl-CoA synthetase  55.16 
 
 		 650 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0370757  hitchhiker  0.0000659795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2653  acetoacetyl-CoA synthetase  86.13 
 
 		 650 aa  1129    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1185  acetoacetyl-CoA synthetase  50.62 
 
 		 650 aa  686    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4886  acetoacetyl-CoA synthase  53.65 
 
 		 657 aa  735    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1658  acetoacetyl-CoA synthetase  57.56 
 
 		 662 aa  728    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0036  acetoacetyl-CoA synthetase  55.49 
 
 		 662 aa  720    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2108  acetoacetyl-CoA synthetase  49.46 
 
 		 651 aa  624  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188473 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1714  acetoacetyl-CoA synthetase  49.54 
 
 		 687 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.776218  normal  0.102104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2277  acetoacetyl-CoA synthetase  44.81 
 
 		 667 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05420  acetoacetyl-CoA synthetase  43.95 
 
 		 656 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1970  acetoacetyl-CoA synthetase  44.81 
 
 		 676 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0246  acetoacetyl-CoA synthetase  45.74 
 
 		 661 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0089  acetoacetyl-CoA synthetase  45.78 
 
 		 662 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848036  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001479  acetoacetyl-CoA synthetase  44.55 
 
 		 657 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.525178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3829  acetoacetyl-CoA synthetase  44.36 
 
 		 657 aa  569  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000409  acetoacetyl-CoA synthetase  44.14 
 
 		 695 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3294  acetoacetyl-CoA synthetase  45.6 
 
 		 676 aa  568  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2245  acetoacetyl-CoA synthetase  47 
 
 		 654 aa  566  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0406  acetoacetyl-CoA synthetase  44.53 
 
 		 659 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000302212  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0879  acetoacetyl-CoA synthetase  46.32 
 
 		 664 aa  557  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.361725  normal  0.0726893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0788  acetoacetyl-CoA synthase  46.07 
 
 		 645 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1953  acetoacetyl-CoA synthetase  43.96 
 
 		 657 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0006  acetoacetyl-CoA synthetase  45.36 
 
 		 646 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.497617  normal  0.392863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0937  acetoacetyl-CoA synthetase  46.01 
 
 		 665 aa  544  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4421  acetoacetyl-CoA synthase  43.64 
 
 		 656 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1444  acetyl-CoA synthetase  43.61 
 
 		 681 aa  538  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2270  acetoacetyl-CoA synthase  44.12 
 
 		 654 aa  535  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4482  acetoacetyl-CoA synthase  44.56 
 
 		 662 aa  535  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.984378  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2133  acetoacetyl-CoA synthase  43.43 
 
 		 667 aa  535  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569736  decreased coverage  0.00936242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4014  acetoacetyl-CoA synthase  44.1 
 
 		 667 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2699  acetoacetyl-CoA synthetase  42.19 
 
 		 669 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1209  acetoacetyl-CoA synthetase  42.11 
 
 		 665 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2342  acetoacetyl-CoA synthetase  44.24 
 
 		 660 aa  526  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0152  acetoacetyl-CoA synthase  44.88 
 
 		 651 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3504  acetoacetyl-CoA synthetase  44.68 
 
 		 709 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.315612 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0304  acetoacetyl-CoA synthase  43.03 
 
 		 667 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4181  acetoacetyl-CoA synthase  41.65 
 
 		 646 aa  525  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.166817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3253  acetoacetyl-CoA synthase  42.37 
 
 		 685 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01880  acetoacetyl-CoA synthase  43.27 
 
 		 673 aa  520  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0764  acetoacetyl-CoA synthetase  40.97 
 
 		 671 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6018  acetoacetyl-CoA synthase  44.05 
 
 		 667 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2192  acetoacetyl-CoA synthetase  43.25 
 
 		 669 aa  515  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4892  acetoacetyl-CoA synthase  41.9 
 
 		 666 aa  507  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3920  acetoacetyl-CoA synthase  40.93 
 
 		 649 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1154  acetoacetyl-CoA synthetase  40.37 
 
 		 666 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal  0.586098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3863  acetoacetyl-CoA synthase  41.35 
 
 		 669 aa  500  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556445  normal  0.0884622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5085  acetoacetyl-CoA synthetase  39.97 
 
 		 643 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293812  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0655  acetoacetyl-CoA synthetase  41.13 
 
 		 684 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0662658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0699  acetoacetyl-CoA synthetase  40.98 
 
 		 684 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0880431  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4700  acetoacetyl-CoA synthetase  39.97 
 
 		 643 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1569  acetoacetyl-CoA synthetase  41.45 
 
 		 664 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4786  acetoacetyl-CoA synthetase  39.97 
 
 		 643 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434813  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01103  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_1G11880)  42.19 
 
 		 690 aa  481  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1473  acetoacetyl-CoA synthetase  39.04 
 
 		 637 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5298  acetoacetyl-CoA synthetase  39.97 
 
 		 632 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0107  acetoacetyl-CoA synthetase  39.72 
 
 		 671 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.924378  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0074  acetoacetyl-CoA synthetase  39.19 
 
 		 695 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0087  acetoacetyl-CoA synthetase  39.61 
 
 		 704 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.387097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0119  acetoacetyl-CoA synthetase  38.54 
 
 		 727 aa  445  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0120  acetoacetyl-CoA synthetase  38.67 
 
 		 696 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.666374  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04900  conserved hypothetical protein  37.32 
 
 		 698 aa  426  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7003  acetoacetyl-CoA synthase  39.6 
 
 		 1056 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3963  acetoacetyl-CoA synthetase  36.74 
 
 		 711 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191797  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1149  acetoacetyl-CoA synthase  36.88 
 
 		 654 aa  423  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.335784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3179  acetoacetyl-CoA synthetase  37.54 
 
 		 695 aa  425  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1363  acetoacetyl-CoA synthase  39.23 
 
 		 654 aa  422  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0916  acetoacetyl-CoA synthase  41.86 
 
 		 971 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4720  acetoacetyl-CoA synthase  39.03 
 
 		 1021 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0054  acetoacetyl-CoA synthetase  36.61 
 
 		 754 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2019  acetoacetyl-CoA synthase  38.38 
 
 		 658 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000482159  normal  0.0114668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0443  acetoacetyl-CoA synthase  39.68 
 
 		 988 aa  401  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303442  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3315  acetoacetyl-CoA synthase  35.14 
 
 		 620 aa  385  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01482  acetoacetyl-CoA synthase (AFU_orthologue; AFUA_8G04770)  35.87 
 
 		 698 aa  375  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  38.85 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 642 aa  289  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2554  acetoacetyl-CoA synthase, putative  30.17 
 
 		 646 aa  286  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2609  putative acetoacetyl-CoA synthase  30.17 
 
 		 646 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>