More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1304 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1304  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
356 aa  711    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.19327  normal  0.319474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2703  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.4 
 
 
348 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1146  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.61 
 
 
355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0462  alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 
348 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4017  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.97 
 
 
368 aa  203  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344704  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0797  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.15 
 
 
356 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3495  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.61 
 
 
370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2591  alcohol dehydrogenase  39.61 
 
 
370 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.596845  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0391  alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 
348 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.18 
 
 
354 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249944  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2814  putative dehydrogenase  36.62 
 
 
349 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4392  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.16 
 
 
356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1301  galactose 1-dehydrogenase / glucose 1-dehydrogenase  35.46 
 
 
358 aa  182  8.000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.22 
 
 
365 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4177  alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
358 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.886524  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0941  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.73 
 
 
360 aa  169  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000857514  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0792  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.9 
 
 
366 aa  169  8e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1714  alcohol dehydrogenase  32.19 
 
 
366 aa  168  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.656799  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1681  alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
350 aa  159  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217905  hitchhiker  0.000000155935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6870  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
343 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
350 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.02 
 
 
335 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.01 
 
 
339 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
327 aa  99.4  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  31 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 
344 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
345 aa  92.4  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  30.34 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.29 
 
 
333 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
336 aa  92  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  27.25 
 
 
350 aa  90.5  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
335 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  30.68 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.97 
 
 
356 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.25 
 
 
341 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
330 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3849  alcohol dehydrogenase  27.19 
 
 
336 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.66 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.89 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0338  alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0885  alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.57 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.48 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.34 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4519  alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.26 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.09 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427157  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  29.79 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1548  alcohol dehydrogenase  25.99 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0106468  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  26.33 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.18 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0293801  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.08 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.39 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.06 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  27.98 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.7 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.82 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  26.36 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3336  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.93 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2116  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.76 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796302 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.08 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  28.82 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.3 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.07 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1814  alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.750902  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.44 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.11 
 
 
352 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.86 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2531  alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.43 
 
 
343 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  24.16 
 
 
339 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  27.57 
 
 
336 aa  77  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.5 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  25.8 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  27.92 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.463233 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.16 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  26.07 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  24.16 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  24.16 
 
 
339 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2683  alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  27.76 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1176  alcohol dehydrogenase  25.66 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1949  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0237239  hitchhiker  9.46914e-17 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.56 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>