More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0941 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0941  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
360 aa  736    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000857514  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1301  galactose 1-dehydrogenase / glucose 1-dehydrogenase  54.85 
 
 
358 aa  401  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0792  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.13 
 
 
366 aa  288  1e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1714  alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 
366 aa  277  2e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.656799  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3495  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.89 
 
 
370 aa  175  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2591  alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.596845  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1304  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
356 aa  169  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.19327  normal  0.319474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2814  putative dehydrogenase  31.69 
 
 
349 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4017  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.01 
 
 
368 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2703  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.61 
 
 
348 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0391  alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0462  alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.82 
 
 
354 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249944  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4177  alcohol dehydrogenase  29.23 
 
 
358 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.886524  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1146  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.31 
 
 
355 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4392  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.86 
 
 
356 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0797  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.53 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1681  alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217905  hitchhiker  0.000000155935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.12 
 
 
365 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6870  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.52 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  27.8 
 
 
341 aa  97.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  28.87 
 
 
341 aa  95.1  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  28.18 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.07 
 
 
340 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0293801  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  29.17 
 
 
341 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  29.17 
 
 
341 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  29.17 
 
 
341 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  28.18 
 
 
341 aa  93.6  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  28.18 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  28.18 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  28.18 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.8 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  27.12 
 
 
341 aa  93.2  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  27.84 
 
 
341 aa  92.8  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  27.46 
 
 
341 aa  92.4  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  28.79 
 
 
341 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  27.47 
 
 
336 aa  92  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  27.49 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  28.57 
 
 
342 aa  90.1  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  26.21 
 
 
342 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  27.49 
 
 
338 aa  89.7  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  27.98 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.51 
 
 
348 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.1 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  26.87 
 
 
340 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  26.22 
 
 
343 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  26.57 
 
 
343 aa  86.7  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  26.57 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  26.28 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.48 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  27.43 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1306  alcohol dehydrogenase  28.76 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2686  L-threonine 3-dehydrogenase  26.64 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00603723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.49 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  26.77 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  26.32 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  25.87 
 
 
360 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.49 
 
 
347 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  27.11 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  26.82 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4973  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554494  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  26.82 
 
 
343 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1696  threonine dehydrogenase  25.82 
 
 
334 aa  82  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000265476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  23.79 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  25.27 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  26.82 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1937  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.64 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.39 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3116  L-threonine 3-dehydrogenase  27.2 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.717555 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  26.74 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5320  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  27.56 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  25.73 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  24.91 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4535  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5157  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5702  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2410  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.13 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  27.67 
 
 
343 aa  79.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3178  L-threonine 3-dehydrogenase  27.2 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  25.94 
 
 
344 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.58 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  25.61 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  25.87 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  25.87 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.45 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0006  L-threonine 3-dehydrogenase  26.82 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.02 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  31.28 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  29.54 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>