More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0391 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0391  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
348 aa  700    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0462  alcohol dehydrogenase  84.48 
 
 
348 aa  584  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2703  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.86 
 
 
348 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4177  alcohol dehydrogenase  56.82 
 
 
358 aa  368  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.886524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2814  putative dehydrogenase  52 
 
 
349 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1681  alcohol dehydrogenase  51.01 
 
 
350 aa  329  4e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217905  hitchhiker  0.000000155935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6870  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.39 
 
 
343 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1304  alcohol dehydrogenase  37.29 
 
 
356 aa  199  7e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.19327  normal  0.319474 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4392  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.92 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0797  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.22 
 
 
356 aa  170  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1146  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.96 
 
 
355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1301  galactose 1-dehydrogenase / glucose 1-dehydrogenase  32.78 
 
 
358 aa  160  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.07 
 
 
365 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.65 
 
 
354 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249944  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3495  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.05 
 
 
370 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0941  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.44 
 
 
360 aa  150  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000857514  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4017  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.58 
 
 
368 aa  149  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344704  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2591  alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.596845  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0792  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.37 
 
 
366 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1714  alcohol dehydrogenase  29.22 
 
 
366 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.656799  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.69 
 
 
345 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  27.42 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2565  L-threonine 3-dehydrogenase  26.33 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  23.82 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  25.88 
 
 
342 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1805  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.657982  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.3 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  30.56 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.15 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0293801  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.54 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.31 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3849  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  26.32 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.78 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.7 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2797  L-threonine 3-dehydrogenase  27.15 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  26.93 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.36 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  27.64 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2686  L-threonine 3-dehydrogenase  27.64 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00603723  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1659  alcohol dehydrogenase  26.76 
 
 
339 aa  67  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741659  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  27.08 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  27.09 
 
 
351 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.72 
 
 
360 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4454  alcohol dehydrogenase  26.27 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.77 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.13 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.7 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.73 
 
 
347 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  35.64 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  28.16 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1516  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3519  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  28.3 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  25 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1737  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.67 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3448  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  28.3 
 
 
347 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  28.78 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  23.73 
 
 
341 aa  63.5  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.27 
 
 
333 aa  63.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3616  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  28.3 
 
 
347 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.28 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 
336 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1306  alcohol dehydrogenase  26.53 
 
 
348 aa  63.2  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  23.77 
 
 
363 aa  63.2  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.81 
 
 
338 aa  62.8  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.65 
 
 
338 aa  62.8  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3450  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  28.3 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6366  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
207 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0807  alcohol dehydrogenase  31.28 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0463124 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1548  alcohol dehydrogenase  23.99 
 
 
350 aa  62  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0106468  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  24.56 
 
 
343 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  25.91 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  24.78 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1310  L-threonine 3-dehydrogenase  25.56 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 
336 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.36 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  27.34 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0513  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.17 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  25.94 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3701  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.18 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2116  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.38 
 
 
373 aa  60.8  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  24.56 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0484  alcohol dehydrogenase  24.86 
 
 
367 aa  60.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  24.56 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  24.56 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0499  alcohol dehydrogenase  25.71 
 
 
367 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00895021  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4353  alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  26.38 
 
 
341 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  24.56 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  24.56 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  27.42 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.17 
 
 
346 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6852  alcohol dehydrogenase  27.84 
 
 
340 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>