More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1301 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1301  galactose 1-dehydrogenase / glucose 1-dehydrogenase  100 
 
 
358 aa  724    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0941  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.85 
 
 
360 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000857514  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0792  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.29 
 
 
366 aa  299  4e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1714  alcohol dehydrogenase  41.69 
 
 
366 aa  281  1e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.656799  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1304  alcohol dehydrogenase  35.46 
 
 
356 aa  182  8.000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.19327  normal  0.319474 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1681  alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 
350 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217905  hitchhiker  0.000000155935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0462  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
348 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0391  alcohol dehydrogenase  32.78 
 
 
348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2814  putative dehydrogenase  32.88 
 
 
349 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2703  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.7 
 
 
348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4017  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.29 
 
 
368 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344704  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4177  alcohol dehydrogenase  32.71 
 
 
358 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.886524  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3495  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.98 
 
 
370 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2591  alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.596845  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6870  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.32 
 
 
343 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4392  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.89 
 
 
356 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1146  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.8 
 
 
355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.99 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249944  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0797  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.92 
 
 
356 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.08 
 
 
365 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.87 
 
 
347 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 
338 aa  97.4  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  29.83 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.47 
 
 
345 aa  93.6  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.68 
 
 
346 aa  92.8  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  25.44 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  27.17 
 
 
356 aa  86.7  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.98 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0293801  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  25.27 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.27 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1426  putative alcohol dehydrogenase  26.22 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.967843  normal  0.34363 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  26.24 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  25.07 
 
 
340 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  24.34 
 
 
342 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  23.46 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.93 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.88 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  25 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.06 
 
 
350 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0934  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2076  L-threonine 3-dehydrogenase  23.08 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0654334  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.21 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  25.78 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  25.44 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  26.09 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0598  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.86 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122264  normal  0.243738 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.3 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  25.78 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  24.23 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2697  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.8 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1132  alcohol dehydrogenase  24.8 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  25.9 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  25.28 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.55 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2517  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.63 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1937  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25 
 
 
344 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.29 
 
 
344 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  24.66 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02437  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  24.52 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1123  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.8 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  23.97 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  24.57 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.96 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.88 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.03 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1516  alcohol dehydrogenase  25.42 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4129  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  25.79 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2698  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.8 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02401  hypothetical protein  24.52 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.13 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2830  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.8 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0834  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  25.48 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.54 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  24.85 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  25.14 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  23.03 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.9 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.164909  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  23.61 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  24.32 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.173553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  25.78 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.85 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  25.78 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.51 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  25.78 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  25.37 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  26.26 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  24.22 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2251  alcohol dehydrogenase  26.45 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0513  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.31 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14560  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  25.7 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0972559 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  24.22 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  25.79 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2797  L-threonine 3-dehydrogenase  24.02 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  24.22 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  27.36 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.79 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.24 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  23.29 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  24.31 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5905  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  28.35 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.22496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>