More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4017 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4017  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
368 aa  754    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344704  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1304  alcohol dehydrogenase  38.97 
 
 
356 aa  203  3e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.19327  normal  0.319474 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0797  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.81 
 
 
356 aa  199  9e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.26 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1146  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.24 
 
 
355 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2703  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.45 
 
 
348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
354 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249944  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4392  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.17 
 
 
356 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2814  putative dehydrogenase  33.43 
 
 
349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1681  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217905  hitchhiker  0.000000155935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4177  alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
358 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.886524  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0792  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.22 
 
 
366 aa  155  9e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1714  alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
366 aa  152  8e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.656799  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0941  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.01 
 
 
360 aa  151  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000857514  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0462  alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1301  galactose 1-dehydrogenase / glucose 1-dehydrogenase  32.29 
 
 
358 aa  146  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0391  alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 
348 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2591  alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 
370 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.596845  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3495  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.87 
 
 
370 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6870  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.19 
 
 
343 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.79 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.48 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  26.27 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  26.77 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.27 
 
 
339 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  26.27 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  26.63 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  25.34 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  26.27 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  26.27 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.69 
 
 
349 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  25.33 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  26.27 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.27 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.83 
 
 
337 aa  63.2  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.33 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2101  alcohol dehydrogenase  27.87 
 
 
340 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  24.78 
 
 
335 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1805  alcohol dehydrogenase  29.76 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.657982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  25.24 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4414  aryl-alcohol dehydrogenase  26.13 
 
 
370 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.62 
 
 
346 aa  60.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3245  alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 
374 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  29.61 
 
 
352 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.51 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3810  alcohol dehydrogenase  25.23 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0863215  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3200  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  24.74 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  24.32 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.15 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2341  alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 
348 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.73 
 
 
336 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  24.32 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
347 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  24.32 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  24.64 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  25.54 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  28.41 
 
 
338 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.72 
 
 
342 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6309  alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 
337 aa  56.6  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33332  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.84 
 
 
347 aa  56.6  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16590  xylitol dehydrogenase, zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  27.6 
 
 
346 aa  56.2  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.72 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3972  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  43.18 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.98607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  24.23 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.57 
 
 
342 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3193  alcohol dehydrogenase  25.25 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.98 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  26.49 
 
 
336 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  23.53 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  25.58 
 
 
345 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.89 
 
 
352 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.35 
 
 
368 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.37 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  25.1 
 
 
342 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.11 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  26.3 
 
 
288 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  25.37 
 
 
347 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.61 
 
 
341 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  25.37 
 
 
347 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.37 
 
 
347 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.75 
 
 
317 aa  53.5  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  26.12 
 
 
347 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  25.37 
 
 
347 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1823  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.09 
 
 
333 aa  53.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5114  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  42.05 
 
 
369 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0338  alcohol dehydrogenase  26.21 
 
 
352 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  25.74 
 
 
347 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  25.29 
 
 
351 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  25.29 
 
 
351 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.91 
 
 
361 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  26.82 
 
 
358 aa  53.1  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.38 
 
 
342 aa  53.1  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0108  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  42.05 
 
 
369 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2683  alcohol dehydrogenase  26.88 
 
 
347 aa  53.1  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  24.29 
 
 
344 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  24.91 
 
 
347 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4609  putative dehydrogenase  27.99 
 
 
337 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.118781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>