More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6870 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6870  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
343 aa  656    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1681  alcohol dehydrogenase  58.5 
 
 
350 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217905  hitchhiker  0.000000155935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4177  alcohol dehydrogenase  59.13 
 
 
358 aa  319  5e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.886524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2814  putative dehydrogenase  53.71 
 
 
349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2703  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.15 
 
 
348 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0462  alcohol dehydrogenase  53.23 
 
 
348 aa  282  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0391  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 
348 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1301  galactose 1-dehydrogenase / glucose 1-dehydrogenase  34.62 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1304  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 
356 aa  139  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.19327  normal  0.319474 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0941  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.52 
 
 
360 aa  129  9.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000857514  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4017  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.71 
 
 
368 aa  126  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344704  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0797  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.32 
 
 
356 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.82 
 
 
354 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249944  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0792  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.9 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3495  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.29 
 
 
370 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2591  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
370 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.596845  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1146  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.34 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1714  alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 
366 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.656799  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.08 
 
 
365 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4392  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.28 
 
 
356 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.19 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  29.64 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  30.49 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  22.65 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.18 
 
 
352 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.28 
 
 
367 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 
345 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  26.39 
 
 
358 aa  63.5  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 
347 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.07 
 
 
345 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 
345 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  31.82 
 
 
342 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.19 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.97 
 
 
335 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.9 
 
 
342 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.45 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08552  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01490)  27.83 
 
 
363 aa  60.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
336 aa  60.1  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1426  putative alcohol dehydrogenase  24.92 
 
 
332 aa  59.7  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.967843  normal  0.34363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.88 
 
 
325 aa  59.3  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  26.8 
 
 
353 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  27.16 
 
 
373 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1882  alcohol dehydrogenase  25.78 
 
 
318 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
336 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  27.68 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4519  alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.63 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.23 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.44 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  24.93 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.36 
 
 
344 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.04 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  31.32 
 
 
335 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.32 
 
 
344 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1789  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.490533  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3582  alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0394  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  24.1 
 
 
345 aa  56.6  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.43 
 
 
345 aa  56.6  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.78 
 
 
317 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
336 aa  56.2  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2374  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.78 
 
 
317 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000195271  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  25.52 
 
 
359 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  23.88 
 
 
347 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  23.88 
 
 
347 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  31.65 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.48 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.57 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  25.81 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.22 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.53 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  29.78 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6089  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.17 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1007  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.3 
 
 
348 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.706693  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3701  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.8 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5082  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.94 
 
 
333 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.206655  normal  0.31977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0771  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  26.89 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.54 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.91 
 
 
347 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.18 
 
 
341 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.91 
 
 
374 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3224  alcohol dehydrogenase  28.17 
 
 
317 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.02058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3921  alcohol dehydrogenase  28.01 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  31.71 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  27.73 
 
 
360 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  28.77 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  24.92 
 
 
350 aa  53.5  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1096  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.17 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  21.86 
 
 
340 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0293801  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1113  alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1124  alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.62 
 
 
348 aa  53.1  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  26.13 
 
 
352 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4595  hypothetical protein  27.86 
 
 
348 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  32.02 
 
 
340 aa  53.1  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>