More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1426 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1426  putative alcohol dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  670    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.967843  normal  0.34363 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1823  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  78.85 
 
 
333 aa  537  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.88 
 
 
336 aa  429  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1615  putative alcohol dehydrogenase  55.39 
 
 
332 aa  343  2e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.923405  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2114  putative alcohol dehydrogenase  42.26 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0785  putative alcohol dehydrogenase  47 
 
 
331 aa  211  2e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0151749  normal  0.604245 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1770  putative alcohol dehydrogenase  45.54 
 
 
331 aa  207  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.754529  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0882  putative alcohol dehydrogenase  41.46 
 
 
331 aa  182  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0398  alcohol dehydrogenase  35.97 
 
 
315 aa  170  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.859369  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.14 
 
 
350 aa  163  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
349 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0639  alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
322 aa  152  8e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000239851  hitchhiker  0.000149204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.72 
 
 
342 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.1 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.72 
 
 
342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
342 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  29.53 
 
 
341 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.6 
 
 
341 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.6 
 
 
341 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.6 
 
 
341 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.6 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.6 
 
 
357 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.6 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
342 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1545  alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 
322 aa  143  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0146504 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
342 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.02 
 
 
341 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.47 
 
 
340 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.06 
 
 
336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.06 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
341 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.43 
 
 
351 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
347 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.48 
 
 
339 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.49 
 
 
342 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.08 
 
 
332 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
342 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
342 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.76 
 
 
336 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
342 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
336 aa  135  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.07 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 
342 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  27.86 
 
 
340 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
341 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
342 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.59 
 
 
339 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
338 aa  132  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 
336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 
336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.57 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.11 
 
 
342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4084  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.61 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.406698  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0336  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.97 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  0.594671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4233  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.33 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0229616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.5 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.03 
 
 
342 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 
344 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  28.9 
 
 
342 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.66 
 
 
320 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 
344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.76 
 
 
344 aa  129  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.76 
 
 
344 aa  129  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 
342 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 
342 aa  129  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 
344 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.46 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.11 
 
 
342 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.43 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  27.86 
 
 
341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.03 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4208  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.33 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.12 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2723  alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0619136  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.58 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.63 
 
 
347 aa  127  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 
337 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.32 
 
 
351 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  27.99 
 
 
344 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.03 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 
338 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
327 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 
356 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
341 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>