More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5822 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
338 aa  688    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  77.22 
 
 
337 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.64 
 
 
337 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 
339 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 
339 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  55.19 
 
 
337 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  45.07 
 
 
327 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.68 
 
 
341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.57 
 
 
350 aa  223  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.86 
 
 
342 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 
342 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.57 
 
 
342 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36 
 
 
342 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.71 
 
 
346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
344 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.48 
 
 
342 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
340 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.1 
 
 
342 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
342 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.81 
 
 
342 aa  189  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 
340 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
340 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
360 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 
340 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.9 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  33.33 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.62 
 
 
342 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.67 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.91 
 
 
342 aa  180  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 
341 aa  179  7e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
340 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.07 
 
 
340 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 
326 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5155  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.05 
 
 
321 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.36 
 
 
352 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
339 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.58 
 
 
327 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5001  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.53 
 
 
340 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.773613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4541  alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
340 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  32 
 
 
347 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
339 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
319 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 
336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.11 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.76 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.45 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5054  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.96 
 
 
340 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8814  crotonyl-CoA reductase  30.62 
 
 
436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.24 
 
 
321 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0227  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
349 aa  162  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 
324 aa  162  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2578  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
352 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711518  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
345 aa  162  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
324 aa  162  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
324 aa  162  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 
336 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
337 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
361 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
319 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 
348 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.29 
 
 
327 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 
326 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 
308 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
326 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8289  putative oxidoreductase  35.03 
 
 
320 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.055807  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
326 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0584  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
334 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0645206  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  31.69 
 
 
325 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.26 
 
 
328 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.27 
 
 
325 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.52 
 
 
359 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.24 
 
 
326 aa  155  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.02 
 
 
326 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.49 
 
 
324 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 
326 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3612  crotonyl-CoA reductase  31.11 
 
 
468 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.7 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
326 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.99 
 
 
322 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.84 
 
 
323 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20460  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  31.81 
 
 
368 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4860  alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 
340 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2893  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.85 
 
 
319 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.342375  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.06 
 
 
326 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.52 
 
 
338 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2855  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 
360 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267385  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 
361 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
336 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  31.1 
 
 
328 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0105  crotonyl-CoA reductase  30.52 
 
 
464 aa  150  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
326 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
332 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>