More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5054 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5054  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
340 aa  689    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5001  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  96.18 
 
 
340 aa  610  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.773613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4541  alcohol dehydrogenase  96.18 
 
 
340 aa  610  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  83.82 
 
 
340 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  86.76 
 
 
340 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4860  alcohol dehydrogenase  85 
 
 
340 aa  535  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  68.24 
 
 
340 aa  481  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  68.04 
 
 
342 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.46 
 
 
340 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  68.04 
 
 
360 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  68.24 
 
 
340 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  67.74 
 
 
342 aa  474  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.45 
 
 
342 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.86 
 
 
342 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  67.55 
 
 
342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  68.34 
 
 
340 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  66.86 
 
 
342 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  68.34 
 
 
340 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  65.69 
 
 
342 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61.58 
 
 
342 aa  450  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.03 
 
 
342 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.72 
 
 
342 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  43.61 
 
 
342 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.82 
 
 
341 aa  241  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.54 
 
 
350 aa  223  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.25 
 
 
342 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.76 
 
 
346 aa  212  7e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 
347 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.86 
 
 
342 aa  203  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
361 aa  200  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  35.07 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 
339 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 
337 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  37.42 
 
 
345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.9 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
327 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
358 aa  183  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 
339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.42 
 
 
352 aa  182  9.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  36 
 
 
344 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 
339 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 
339 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  36.26 
 
 
324 aa  172  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
337 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
337 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.13 
 
 
324 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0723  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.12 
 
 
334 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.49 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
336 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
336 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.58 
 
 
327 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.09 
 
 
323 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  35.5 
 
 
344 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.53 
 
 
336 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 
323 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  36.53 
 
 
336 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.36 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  36.89 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  34 
 
 
324 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.45 
 
 
326 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.52 
 
 
323 aa  155  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  37.27 
 
 
324 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.76 
 
 
326 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.85 
 
 
335 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  35.76 
 
 
336 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.67 
 
 
328 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2930  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
346 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6380  alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 
335 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0434732  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.05 
 
 
326 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0584  alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0645206  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
328 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.85 
 
 
336 aa  152  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0534  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
328 aa  151  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  35.06 
 
 
325 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
325 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 
324 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
325 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  34.45 
 
 
326 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
337 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
325 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
325 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8289  putative oxidoreductase  35.19 
 
 
320 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.055807  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.29 
 
 
328 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 
326 aa  149  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
325 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.33 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  32.25 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5155  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.47 
 
 
321 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  33.33 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  32 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  34.83 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.2 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1337  oxidoreductase, zinc-binding protein  33.54 
 
 
336 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.84 
 
 
324 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>