More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3646 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
339 aa  664    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  71.34 
 
 
335 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6065  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.85 
 
 
335 aa  484  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.01709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  72.37 
 
 
335 aa  485  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2006  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  71.04 
 
 
335 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3127  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  71.04 
 
 
405 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3181  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  71.04 
 
 
335 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3164  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  71.04 
 
 
405 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2737  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  71.04 
 
 
335 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0904  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  71.04 
 
 
378 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1871  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  71.04 
 
 
335 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0371  alcohol dehydrogenase  70.27 
 
 
335 aa  467  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1436  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  69.55 
 
 
388 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6380  alcohol dehydrogenase  68.96 
 
 
335 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0434732  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2633  alcohol dehydrogenase  69.07 
 
 
335 aa  428  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  65.07 
 
 
336 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.57 
 
 
336 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  63.55 
 
 
336 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.57 
 
 
335 aa  408  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  63.58 
 
 
337 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.95 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1337  oxidoreductase, zinc-binding protein  60.84 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1153  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.45 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  62.95 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  62.95 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  65.57 
 
 
339 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.68 
 
 
337 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.16 
 
 
334 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.82 
 
 
338 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.4 
 
 
338 aa  289  6e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.56 
 
 
336 aa  281  9e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1864  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  48.53 
 
 
337 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  47.06 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.97 
 
 
332 aa  262  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3980  alcohol dehydrogenase  47.35 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3539  alcohol dehydrogenase  47.35 
 
 
339 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.04 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3146  alcohol dehydrogenase  46.04 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0679914  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2595  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.67 
 
 
339 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519018  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3343  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.91 
 
 
337 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0980  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  45.87 
 
 
341 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449536  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  44.64 
 
 
336 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5137  alcohol dehydrogenase  46.67 
 
 
339 aa  241  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138562  normal  0.497782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.45 
 
 
332 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.87 
 
 
337 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3286  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.63 
 
 
340 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135792  normal  0.0584274 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03873  zinc-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08240)  43.99 
 
 
347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0362  alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 
333 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0566  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.43 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329939  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6869  alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 
341 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8677  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.36 
 
 
338 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2362  alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 
367 aa  215  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07636  oxidoreductase (Eurofung)  38.66 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.499872  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.04 
 
 
342 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525287  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3527  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 
336 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.845395  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2700  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.37 
 
 
334 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739521  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2233  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.74 
 
 
352 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0745  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.71 
 
 
339 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4979  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.82 
 
 
336 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403893  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00280  alcohol dehydrogenase, putative  35.19 
 
 
365 aa  176  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.82 
 
 
342 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06439  conserved hypothetical protein  39.77 
 
 
358 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09366  conserved hypothetical protein  38.7 
 
 
312 aa  166  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00133141  normal  0.0115183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.66 
 
 
342 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.66 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.79 
 
 
342 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.86 
 
 
329 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0026  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.71 
 
 
339 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.68 
 
 
342 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
344 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5297  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.48 
 
 
320 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13031  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 
342 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.16 
 
 
359 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.25 
 
 
329 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.25 
 
 
329 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  32.25 
 
 
329 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.25 
 
 
329 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.66 
 
 
329 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
340 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 
338 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.75 
 
 
350 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
339 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
329 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.47 
 
 
329 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
325 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
345 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  33.93 
 
 
342 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
342 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.03 
 
 
341 aa  142  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.84 
 
 
317 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.93 
 
 
342 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 
329 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.52 
 
 
342 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  33.43 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.88 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>