More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2700 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2700  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
334 aa  646    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739521  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0362  alcohol dehydrogenase  46.11 
 
 
333 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.68 
 
 
332 aa  233  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 
336 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.88 
 
 
337 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4979  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.51 
 
 
336 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3286  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.28 
 
 
340 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135792  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2362  alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 
367 aa  219  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.35 
 
 
338 aa  215  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0980  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  43.41 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449536  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 
337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.25 
 
 
338 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3539  alcohol dehydrogenase  41.37 
 
 
339 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.39 
 
 
336 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3980  alcohol dehydrogenase  41.07 
 
 
339 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2595  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.37 
 
 
339 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519018  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.88 
 
 
337 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5137  alcohol dehydrogenase  41.07 
 
 
339 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138562  normal  0.497782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
337 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6869  alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 
341 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.405297 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07636  oxidoreductase (Eurofung)  37.07 
 
 
353 aa  204  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.499872  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3146  alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 
337 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0679914  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1864  alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.84 
 
 
334 aa  199  7.999999999999999e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3343  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.18 
 
 
337 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525287  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
336 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
335 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6065  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.25 
 
 
335 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.01709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.38 
 
 
332 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.95 
 
 
336 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
336 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
336 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0745  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.75 
 
 
339 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  40.37 
 
 
339 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.87 
 
 
337 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1153  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.74 
 
 
336 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  39.08 
 
 
337 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  39.44 
 
 
335 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6380  alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0434732  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1436  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.42 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.09 
 
 
335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2737  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.06 
 
 
335 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537228  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1871  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.06 
 
 
335 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2006  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.06 
 
 
335 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3181  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.06 
 
 
335 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192137  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03873  zinc-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08240)  34.71 
 
 
347 aa  180  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3127  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.06 
 
 
405 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1337  oxidoreductase, zinc-binding protein  34.83 
 
 
336 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0904  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.06 
 
 
378 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3164  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.06 
 
 
405 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0371  alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8677  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.35 
 
 
338 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0566  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.54 
 
 
343 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329939  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 
336 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  36.39 
 
 
336 aa  176  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.05 
 
 
336 aa  175  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  37.31 
 
 
339 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2633  alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
336 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3527  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.845395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0026  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.47 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2233  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.44 
 
 
352 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.99 
 
 
341 aa  159  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00280  alcohol dehydrogenase, putative  33.14 
 
 
365 aa  157  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.83 
 
 
342 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.24 
 
 
342 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
342 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 
332 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32 
 
 
359 aa  149  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.28 
 
 
317 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
341 aa  146  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
327 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.33 
 
 
639 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.05 
 
 
338 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
325 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.19 
 
 
332 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.79 
 
 
324 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5297  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.68 
 
 
320 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  30.72 
 
 
325 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.43 
 
 
328 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.76 
 
 
317 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  31.16 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.4 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  33.24 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.52 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.56 
 
 
329 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.57 
 
 
341 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  29.62 
 
 
5802 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
342 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.74 
 
 
342 aa  136  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
339 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.08 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>