More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3286 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3286  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
340 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135792  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2362  alcohol dehydrogenase  72.32 
 
 
367 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.26 
 
 
337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.3 
 
 
342 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525287  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0980  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  52.94 
 
 
341 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449536  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0362  alcohol dehydrogenase  53.55 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4979  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.34 
 
 
336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403893  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.26 
 
 
335 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
332 aa  235  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0904  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.11 
 
 
378 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0371  alcohol dehydrogenase  46.01 
 
 
335 aa  229  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  47.63 
 
 
339 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3164  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.11 
 
 
405 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3127  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.11 
 
 
405 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2006  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.11 
 
 
335 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3181  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.11 
 
 
335 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2737  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.11 
 
 
335 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537228  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1871  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.11 
 
 
335 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  44.84 
 
 
335 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  43.71 
 
 
336 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2700  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.28 
 
 
334 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739521  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.48 
 
 
338 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.6 
 
 
338 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6065  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.67 
 
 
335 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.01709 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1337  oxidoreductase, zinc-binding protein  42.14 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1436  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.59 
 
 
388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1153  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.77 
 
 
336 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2633  alcohol dehydrogenase  45.69 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  46.04 
 
 
339 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.77 
 
 
336 aa  212  7e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.1 
 
 
334 aa  212  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6380  alcohol dehydrogenase  45.66 
 
 
335 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0434732  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6869  alcohol dehydrogenase  42.58 
 
 
341 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
337 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.59 
 
 
335 aa  209  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  40.83 
 
 
336 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.28 
 
 
332 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.42 
 
 
336 aa  209  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.23 
 
 
337 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  43.13 
 
 
336 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3980  alcohol dehydrogenase  40.55 
 
 
339 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.85 
 
 
336 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 
336 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3539  alcohol dehydrogenase  40.5 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  40.76 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2595  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.63 
 
 
339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519018  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3146  alcohol dehydrogenase  40.92 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0679914  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 
336 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1864  alcohol dehydrogenase  43.06 
 
 
337 aa  200  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  42.49 
 
 
337 aa  198  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  41.06 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.76 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5137  alcohol dehydrogenase  40.62 
 
 
339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138562  normal  0.497782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  40.13 
 
 
337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3343  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.18 
 
 
337 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03873  zinc-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08240)  36.31 
 
 
347 aa  186  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0745  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07636  oxidoreductase (Eurofung)  35 
 
 
353 aa  179  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.499872  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8677  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.99 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0566  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.18 
 
 
343 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0026  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.11 
 
 
339 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3527  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
336 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.845395  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2233  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.62 
 
 
352 aa  156  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.87 
 
 
342 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.82 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06439  conserved hypothetical protein  34.46 
 
 
358 aa  145  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.04 
 
 
341 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.58 
 
 
359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00280  alcohol dehydrogenase, putative  33.13 
 
 
365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.23 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  33.04 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.93 
 
 
342 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  32.46 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.35 
 
 
342 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 
332 aa  135  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  32.65 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.14 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5297  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.53 
 
 
320 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13031  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
346 aa  133  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
325 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.96 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09366  conserved hypothetical protein  33.44 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00133141  normal  0.0115183 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.12 
 
 
639 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.06 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.94 
 
 
328 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
325 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.09 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 
339 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.04 
 
 
325 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.76 
 
 
350 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
339 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10793  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13270)  33.23 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523451  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.5 
 
 
326 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
341 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>