More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0566 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0566  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
343 aa  703    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329939  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.53 
 
 
332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
336 aa  292  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.16 
 
 
338 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
336 aa  286  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  45.23 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.91 
 
 
334 aa  272  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.23 
 
 
336 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.71 
 
 
335 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.86 
 
 
338 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6065  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.81 
 
 
335 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.01709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3146  alcohol dehydrogenase  44.31 
 
 
337 aa  259  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0679914  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.31 
 
 
337 aa  259  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  46.39 
 
 
337 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  49.04 
 
 
335 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  48.43 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3343  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.18 
 
 
337 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3980  alcohol dehydrogenase  43.64 
 
 
339 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  46.62 
 
 
337 aa  248  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.4 
 
 
337 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0371  alcohol dehydrogenase  46.47 
 
 
335 aa  245  8e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3539  alcohol dehydrogenase  43.89 
 
 
339 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6869  alcohol dehydrogenase  46.45 
 
 
341 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5137  alcohol dehydrogenase  46.01 
 
 
339 aa  242  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138562  normal  0.497782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2595  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.38 
 
 
339 aa  242  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519018  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1436  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.43 
 
 
388 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3127  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.1 
 
 
405 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3164  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.1 
 
 
405 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2737  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.1 
 
 
335 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0904  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.1 
 
 
378 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2006  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.1 
 
 
335 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3181  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.1 
 
 
335 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1871  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.1 
 
 
335 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07636  oxidoreductase (Eurofung)  40.95 
 
 
353 aa  237  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.499872  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  45.02 
 
 
336 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1864  alcohol dehydrogenase  45.37 
 
 
337 aa  236  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1153  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.56 
 
 
336 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1337  oxidoreductase, zinc-binding protein  41.56 
 
 
336 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.44 
 
 
335 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  43.91 
 
 
336 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.91 
 
 
336 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  43.91 
 
 
336 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  43.91 
 
 
336 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03873  zinc-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08240)  41.32 
 
 
347 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2362  alcohol dehydrogenase  42.64 
 
 
367 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0980  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
341 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449536  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2633  alcohol dehydrogenase  45.69 
 
 
335 aa  222  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6380  alcohol dehydrogenase  46.95 
 
 
335 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0434732  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.99 
 
 
332 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  43.53 
 
 
339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  41.42 
 
 
336 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.21 
 
 
342 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525287  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 
336 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2700  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.54 
 
 
334 aa  206  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739521  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3527  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.1 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.845395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3286  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.18 
 
 
340 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135792  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.05 
 
 
337 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0362  alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 
333 aa  192  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8677  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.22 
 
 
338 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0745  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.46 
 
 
339 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09366  conserved hypothetical protein  39.87 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00133141  normal  0.0115183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.73 
 
 
359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0026  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.11 
 
 
339 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4979  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.65 
 
 
336 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403893  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00280  alcohol dehydrogenase, putative  34.23 
 
 
365 aa  176  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2233  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.2 
 
 
352 aa  175  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 
331 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
329 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
329 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.32 
 
 
329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06439  conserved hypothetical protein  37.54 
 
 
358 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.8 
 
 
329 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.8 
 
 
329 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
329 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.8 
 
 
329 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.02 
 
 
329 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.72 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.95 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.24 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.65 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5297  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.25 
 
 
320 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13031  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10793  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13270)  31.82 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523451  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.37 
 
 
341 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
347 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  34.16 
 
 
342 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.93 
 
 
346 aa  136  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.71 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  34 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.76 
 
 
350 aa  133  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03571  alcohol dehydrogenase  39.44 
 
 
198 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.123408  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.23 
 
 
342 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 
339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0888  NADPH/quinone reductase  33.87 
 
 
330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.77 
 
 
331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.55 
 
 
342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>