More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3343 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  95.24 
 
 
337 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3146  alcohol dehydrogenase  94.94 
 
 
337 aa  642    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0679914  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3343  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
337 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  56.51 
 
 
336 aa  345  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.68 
 
 
336 aa  341  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.46 
 
 
338 aa  334  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.92 
 
 
332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3539  alcohol dehydrogenase  49.56 
 
 
339 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2595  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.82 
 
 
339 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519018  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  50.59 
 
 
337 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3980  alcohol dehydrogenase  51.51 
 
 
339 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  46.57 
 
 
336 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6869  alcohol dehydrogenase  48.4 
 
 
341 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5137  alcohol dehydrogenase  47.34 
 
 
339 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138562  normal  0.497782 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1864  alcohol dehydrogenase  47.85 
 
 
337 aa  275  9e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03873  zinc-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08240)  46.55 
 
 
347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  46.27 
 
 
336 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.35 
 
 
334 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.29 
 
 
338 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8677  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.35 
 
 
338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07636  oxidoreductase (Eurofung)  44.93 
 
 
353 aa  266  5e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.499872  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3527  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.63 
 
 
336 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.845395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0745  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.21 
 
 
339 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.41 
 
 
332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  45.91 
 
 
339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0371  alcohol dehydrogenase  45.72 
 
 
335 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 
335 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1871  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.43 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2006  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.43 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2737  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.43 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3181  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.43 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3164  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.43 
 
 
405 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3127  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.43 
 
 
405 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0904  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.43 
 
 
378 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.37 
 
 
336 aa  239  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6065  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.79 
 
 
335 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.01709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0362  alcohol dehydrogenase  44.25 
 
 
333 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1436  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.49 
 
 
388 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0980  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 
341 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449536  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  45.54 
 
 
337 aa  236  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2233  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.99 
 
 
352 aa  235  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  44.59 
 
 
336 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
335 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0566  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.18 
 
 
343 aa  229  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329939  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.81 
 
 
337 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.27 
 
 
337 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2362  alcohol dehydrogenase  42.65 
 
 
367 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.09 
 
 
336 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  43.09 
 
 
336 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
336 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.27 
 
 
335 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  42.32 
 
 
336 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
339 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6380  alcohol dehydrogenase  43.4 
 
 
335 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0434732  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5297  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.03 
 
 
320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13031  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2633  alcohol dehydrogenase  43.66 
 
 
335 aa  216  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1153  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.55 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1337  oxidoreductase, zinc-binding protein  38.25 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00280  alcohol dehydrogenase, putative  39.35 
 
 
365 aa  208  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2700  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.18 
 
 
334 aa  206  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739521  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0026  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.72 
 
 
339 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.88 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525287  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3286  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135792  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4979  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.29 
 
 
336 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403893  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09366  conserved hypothetical protein  41.83 
 
 
312 aa  192  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00133141  normal  0.0115183 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06439  conserved hypothetical protein  41.1 
 
 
358 aa  175  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.17 
 
 
341 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.89 
 
 
359 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
341 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 
329 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.54 
 
 
342 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 
342 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.74 
 
 
329 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.33 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.33 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.33 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0336  quinone oxidoreductase putative PIG3  36.31 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  0.594671 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.98 
 
 
342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
329 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.62 
 
 
342 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.45 
 
 
329 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.17 
 
 
341 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 
329 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.76 
 
 
334 aa  142  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.76 
 
 
326 aa  142  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.45 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.91 
 
 
322 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
331 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.05 
 
 
346 aa  136  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4208  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.86 
 
 
326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4084  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
326 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.406698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4233  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.86 
 
 
326 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0229616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03571  alcohol dehydrogenase  43.89 
 
 
198 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.123408  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.34 
 
 
334 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.14 
 
 
338 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.75 
 
 
332 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2736  alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00823064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>