More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0255 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
336 aa  653    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  71.73 
 
 
338 aa  475  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  55.79 
 
 
336 aa  354  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.24 
 
 
332 aa  352  7e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.68 
 
 
337 aa  352  7e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3146  alcohol dehydrogenase  56.38 
 
 
337 aa  348  6e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0679914  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  52.66 
 
 
337 aa  345  8e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3343  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.68 
 
 
337 aa  339  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  51.18 
 
 
337 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3980  alcohol dehydrogenase  51.03 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3539  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.18 
 
 
338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.31 
 
 
334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2595  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50 
 
 
339 aa  305  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519018  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5137  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
339 aa  305  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138562  normal  0.497782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  49.56 
 
 
339 aa  289  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6869  alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 
341 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  48.33 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.25 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0371  alcohol dehydrogenase  48.21 
 
 
335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8677  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.78 
 
 
338 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  46.57 
 
 
336 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  47.09 
 
 
337 aa  278  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  45.32 
 
 
336 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.32 
 
 
336 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  45.32 
 
 
336 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  45.32 
 
 
336 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.63 
 
 
335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.65 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1436  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.56 
 
 
388 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1864  alcohol dehydrogenase  47.71 
 
 
337 aa  273  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  48.02 
 
 
339 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07636  oxidoreductase (Eurofung)  44.06 
 
 
353 aa  271  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.499872  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 
335 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2006  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.27 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3181  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.27 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2737  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.27 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537228  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1871  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.27 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3127  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.27 
 
 
405 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3164  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.27 
 
 
405 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0904  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.27 
 
 
378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03873  zinc-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08240)  45.78 
 
 
347 aa  268  7e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.26 
 
 
337 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6065  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.32 
 
 
335 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.01709 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  45.67 
 
 
336 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1153  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.34 
 
 
336 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1337  oxidoreductase, zinc-binding protein  42.34 
 
 
336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3527  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.37 
 
 
336 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.845395  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0980  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  43.15 
 
 
341 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449536  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0566  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.69 
 
 
343 aa  257  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0362  alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 
333 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.41 
 
 
332 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0745  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.81 
 
 
339 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6380  alcohol dehydrogenase  44.67 
 
 
335 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0434732  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2362  alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 
367 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2633  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
335 aa  235  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4979  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.71 
 
 
336 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.77 
 
 
337 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2233  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.59 
 
 
352 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.47 
 
 
342 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525287  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2700  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.39 
 
 
334 aa  218  8.999999999999998e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739521  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3286  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.72 
 
 
340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135792  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00280  alcohol dehydrogenase, putative  36.17 
 
 
365 aa  201  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5297  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.36 
 
 
320 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13031  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.67 
 
 
359 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0026  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.76 
 
 
339 aa  192  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.55 
 
 
341 aa  186  4e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.64 
 
 
342 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06439  conserved hypothetical protein  39.13 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09366  conserved hypothetical protein  38.69 
 
 
312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00133141  normal  0.0115183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.35 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.95 
 
 
342 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.45 
 
 
341 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
341 aa  175  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
331 aa  172  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
329 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.93 
 
 
329 aa  165  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  37.72 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.01 
 
 
329 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.23 
 
 
329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.23 
 
 
329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.23 
 
 
329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 
345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  35.07 
 
 
328 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.52 
 
 
329 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  36.92 
 
 
342 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  37.46 
 
 
326 aa  159  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
329 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 
339 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
347 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
339 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
339 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0336  quinone oxidoreductase putative PIG3  38.04 
 
 
328 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  0.594671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  35.82 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
329 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.02 
 
 
328 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.57 
 
 
332 aa  152  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>