More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1660 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
337 aa  680    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  68.26 
 
 
336 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.87 
 
 
335 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  66.16 
 
 
336 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  66.37 
 
 
336 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  64.76 
 
 
336 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  64.76 
 
 
336 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  64.76 
 
 
336 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1153  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  64.05 
 
 
336 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1337  oxidoreductase, zinc-binding protein  62.84 
 
 
336 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1436  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.57 
 
 
388 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3164  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  62.28 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2006  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.28 
 
 
335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3181  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.28 
 
 
335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0904  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.28 
 
 
378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1871  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.28 
 
 
335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2737  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.28 
 
 
335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537228  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3127  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  62.28 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  61.98 
 
 
337 aa  401  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  62.8 
 
 
339 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6065  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.08 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.01709 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  61.68 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.06 
 
 
335 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  61.68 
 
 
339 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0371  alcohol dehydrogenase  59.28 
 
 
335 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6380  alcohol dehydrogenase  61.08 
 
 
335 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0434732  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2633  alcohol dehydrogenase  59.28 
 
 
335 aa  364  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.47 
 
 
334 aa  356  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  47.71 
 
 
337 aa  289  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.6 
 
 
338 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.33 
 
 
338 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.75 
 
 
332 aa  263  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.26 
 
 
336 aa  262  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3980  alcohol dehydrogenase  45.22 
 
 
339 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  43.54 
 
 
336 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3539  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 
339 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2595  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.83 
 
 
339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519018  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 
336 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  43.69 
 
 
336 aa  245  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
337 aa  245  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03873  zinc-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08240)  43.03 
 
 
347 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6869  alcohol dehydrogenase  46.06 
 
 
341 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1864  alcohol dehydrogenase  43.29 
 
 
337 aa  238  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3146  alcohol dehydrogenase  42.31 
 
 
337 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0679914  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.31 
 
 
337 aa  235  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5137  alcohol dehydrogenase  44.9 
 
 
339 aa  235  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138562  normal  0.497782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3343  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.81 
 
 
337 aa  226  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.29 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8677  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.7 
 
 
338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07636  oxidoreductase (Eurofung)  40.17 
 
 
353 aa  219  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.499872  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0980  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  41.34 
 
 
341 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449536  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0566  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.4 
 
 
343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329939  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.17 
 
 
337 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0362  alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
333 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.87 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525287  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3527  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 
336 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.845395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3286  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.76 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135792  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2362  alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
367 aa  195  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2700  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.87 
 
 
334 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739521  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00280  alcohol dehydrogenase, putative  35.95 
 
 
365 aa  182  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2233  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 
352 aa  182  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09366  conserved hypothetical protein  40.82 
 
 
312 aa  179  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00133141  normal  0.0115183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4979  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.26 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0745  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 
339 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0026  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.19 
 
 
339 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.18 
 
 
342 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.88 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.46 
 
 
342 aa  162  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06439  conserved hypothetical protein  37.77 
 
 
358 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 
340 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 
340 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
342 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5297  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.22 
 
 
320 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13031  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.17 
 
 
341 aa  155  9e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.97 
 
 
359 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  34.52 
 
 
344 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.81 
 
 
340 aa  149  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 
345 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.22 
 
 
329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  32.75 
 
 
328 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
332 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
342 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.66 
 
 
332 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
339 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.72 
 
 
340 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  32.2 
 
 
342 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
331 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 
329 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  35.06 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 
329 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  28.31 
 
 
329 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1276  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
322 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.914753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>