More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3067 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
340 aa  687    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5001  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  84.12 
 
 
340 aa  551  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.773613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  81.18 
 
 
340 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4541  alcohol dehydrogenase  84.12 
 
 
340 aa  551  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5054  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  83.82 
 
 
340 aa  544  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4860  alcohol dehydrogenase  81.18 
 
 
340 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.64 
 
 
340 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  67.94 
 
 
340 aa  484  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  67.94 
 
 
340 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  68.82 
 
 
340 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  68.82 
 
 
340 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.28 
 
 
342 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  67.16 
 
 
342 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  67.16 
 
 
360 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.69 
 
 
342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  66.86 
 
 
342 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  65.4 
 
 
342 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  66.08 
 
 
342 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  64.22 
 
 
342 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61 
 
 
342 aa  439  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.37 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.86 
 
 
342 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.55 
 
 
342 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 
342 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.55 
 
 
342 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.96 
 
 
342 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.71 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  41.28 
 
 
342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.26 
 
 
339 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.83 
 
 
346 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 
361 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.66 
 
 
341 aa  195  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
338 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
358 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  37.77 
 
 
345 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 
339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.12 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
344 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.98 
 
 
339 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
339 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
337 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
339 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
337 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
337 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
325 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  36.28 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0723  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.91 
 
 
334 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.97 
 
 
328 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 
325 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0584  alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
334 aa  162  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0645206  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  37.09 
 
 
324 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 
328 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.04 
 
 
337 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
325 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 
325 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  33.15 
 
 
324 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.76 
 
 
321 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.76 
 
 
326 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.58 
 
 
327 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.01 
 
 
324 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
324 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
324 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  36.02 
 
 
324 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  34.9 
 
 
325 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 
333 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 
327 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.36 
 
 
322 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.56 
 
 
324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5155  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.29 
 
 
321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.67 
 
 
323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  36.22 
 
 
336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0534  alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
328 aa  153  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.56 
 
 
320 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.28 
 
 
336 aa  153  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  36 
 
 
331 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 
334 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.93 
 
 
323 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2893  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.44 
 
 
319 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.342375  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
324 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
324 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.14 
 
 
328 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
324 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.43 
 
 
332 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.33 
 
 
327 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
322 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.84 
 
 
324 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
336 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
337 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
326 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
344 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  34.04 
 
 
324 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  33.84 
 
 
325 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  34.04 
 
 
324 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.04 
 
 
324 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.15 
 
 
326 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>