More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0723 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0723  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
334 aa  675    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  84.43 
 
 
339 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  83.83 
 
 
339 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  63.5 
 
 
347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  63.5 
 
 
345 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.73 
 
 
342 aa  292  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.43 
 
 
342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.67 
 
 
342 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.6 
 
 
346 aa  259  6e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.27 
 
 
350 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 
344 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  42.34 
 
 
342 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.12 
 
 
342 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 
339 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.1 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.58 
 
 
342 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.27 
 
 
352 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12740  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  41.61 
 
 
321 aa  212  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.33 
 
 
341 aa  211  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5155  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  42.59 
 
 
321 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1225  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.8 
 
 
322 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3680  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.83 
 
 
322 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8289  putative oxidoreductase  42.28 
 
 
320 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.055807  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0584  alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 
334 aa  202  7e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0645206  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0888  NADPH/quinone reductase  39.09 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.14 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4029  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.02 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1276  alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.914753  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  36.28 
 
 
342 aa  196  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.08 
 
 
340 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.36 
 
 
342 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.81 
 
 
319 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1728  alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
325 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.76 
 
 
342 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.78 
 
 
342 aa  191  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1565  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.81 
 
 
320 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0793677  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2893  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.02 
 
 
319 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.342375  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  35.95 
 
 
342 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.65 
 
 
342 aa  188  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.65 
 
 
342 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
331 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 
360 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7575  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.49 
 
 
313 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.19 
 
 
321 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 
340 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32200  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  39.26 
 
 
319 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.497144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
340 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 
340 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.06 
 
 
342 aa  186  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 
340 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 
340 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0982  alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
324 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.711681  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.17 
 
 
341 aa  178  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 
337 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.14 
 
 
329 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3750  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220765  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.89 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.46 
 
 
329 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.13 
 
 
329 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.57 
 
 
329 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.57 
 
 
329 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
329 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
329 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.57 
 
 
329 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
361 aa  172  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
329 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 
339 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5054  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.19 
 
 
340 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
339 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.83 
 
 
340 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2930  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
346 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2114  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.89 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.828454  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5001  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.56 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.773613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4541  alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3694  alcohol dehydrogenase  39.57 
 
 
338 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.250797  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.82 
 
 
359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0362  alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4074  alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 
320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0904553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4860  alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 
340 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.09 
 
 
338 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0534  alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 
328 aa  162  9e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
338 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.71 
 
 
341 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.5 
 
 
338 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1267  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.13 
 
 
322 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.370033  normal  0.178282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.42 
 
 
337 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.23 
 
 
337 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.89 
 
 
332 aa  160  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
337 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  33.23 
 
 
325 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
325 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 
348 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  38.1 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 
337 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
336 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>