More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2114 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2114  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
325 aa  646    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.828454  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32200  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  61.51 
 
 
319 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.497144 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.06 
 
 
319 aa  334  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0888  NADPH/quinone reductase  53.94 
 
 
330 aa  330  2e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1276  alcohol dehydrogenase  54.37 
 
 
322 aa  321  8e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.914753  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0607  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.44 
 
 
319 aa  308  8e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.105254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3680  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.5 
 
 
322 aa  299  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1728  alcohol dehydrogenase  51.54 
 
 
325 aa  299  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2893  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  49.22 
 
 
319 aa  295  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.342375  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0982  alcohol dehydrogenase  51.86 
 
 
324 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.711681  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4029  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.86 
 
 
322 aa  292  6e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8289  putative oxidoreductase  49.53 
 
 
320 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.055807  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.61 
 
 
321 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0584  alcohol dehydrogenase  50.8 
 
 
334 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0645206  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7575  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.31 
 
 
313 aa  281  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.16 
 
 
321 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5155  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  48.28 
 
 
321 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3750  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.17 
 
 
326 aa  275  8e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220765  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12740  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  44.51 
 
 
321 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1225  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.87 
 
 
322 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1267  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.66 
 
 
322 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.370033  normal  0.178282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4074  alcohol dehydrogenase  49.37 
 
 
320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0904553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1565  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.83 
 
 
320 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0793677  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3694  alcohol dehydrogenase  48.12 
 
 
338 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.250797  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 
339 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
339 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
347 aa  159  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.44 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  33.89 
 
 
329 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
329 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.6 
 
 
329 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.44 
 
 
329 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.44 
 
 
329 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.44 
 
 
329 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 
329 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
329 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 
331 aa  143  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.12 
 
 
329 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0723  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.89 
 
 
334 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
339 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.66 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
342 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
342 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
342 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 
337 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.64 
 
 
359 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  30.93 
 
 
340 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.45 
 
 
341 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.31 
 
 
340 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 
360 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.65 
 
 
342 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  30.93 
 
 
342 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  32.89 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  29.97 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.36 
 
 
342 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
340 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  31.66 
 
 
322 aa  119  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.83 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  27.97 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.95 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.87 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.91 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.95 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.73 
 
 
341 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.39 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.07 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.93 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4860  alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 
340 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
338 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  28.36 
 
 
339 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  26.27 
 
 
327 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.32 
 
 
338 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4541  alcohol dehydrogenase  30.16 
 
 
340 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5001  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.16 
 
 
340 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.773613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5054  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.67 
 
 
340 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  26.11 
 
 
358 aa  106  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.18 
 
 
352 aa  105  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  28.09 
 
 
361 aa  105  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.7 
 
 
342 aa  105  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3980  alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 
339 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.38 
 
 
342 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 
337 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3539  alcohol dehydrogenase  31.98 
 
 
339 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
332 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.06 
 
 
339 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  31.8 
 
 
336 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.1 
 
 
342 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525287  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32 
 
 
337 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.41 
 
 
334 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2595  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.05 
 
 
339 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519018  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  30.89 
 
 
336 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6869  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 
336 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>