More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0982 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0982  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
324 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.711681  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3750  zinc-binding alcohol dehydrogenase  78.7 
 
 
326 aa  494  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220765  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1728  alcohol dehydrogenase  67.58 
 
 
325 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2893  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  63.47 
 
 
319 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.342375  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8289  putative oxidoreductase  64.71 
 
 
320 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.055807  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3680  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.36 
 
 
322 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.09 
 
 
321 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4029  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.16 
 
 
322 aa  388  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1276  alcohol dehydrogenase  61.42 
 
 
322 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.914753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7575  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.61 
 
 
313 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12740  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  56.97 
 
 
321 aa  359  3e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1225  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.35 
 
 
322 aa  352  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32200  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  61.23 
 
 
319 aa  351  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.497144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1565  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.39 
 
 
320 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0793677  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.8 
 
 
321 aa  348  6e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0584  alcohol dehydrogenase  57.28 
 
 
334 aa  348  9e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0645206  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5155  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  59.75 
 
 
321 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1267  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.68 
 
 
322 aa  322  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.370033  normal  0.178282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0607  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.63 
 
 
319 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.105254 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.1 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0888  NADPH/quinone reductase  48.96 
 
 
330 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2114  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.86 
 
 
325 aa  293  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.828454  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3694  alcohol dehydrogenase  54.01 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.250797  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4074  alcohol dehydrogenase  53.7 
 
 
320 aa  285  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0904553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 
347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  39.57 
 
 
345 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.16 
 
 
342 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.85 
 
 
342 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.55 
 
 
342 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.37 
 
 
350 aa  177  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 
339 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 
339 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 
329 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  40.79 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.96 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
329 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.32 
 
 
329 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.65 
 
 
342 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 
342 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.32 
 
 
329 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.32 
 
 
329 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
329 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.32 
 
 
329 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.32 
 
 
329 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.87 
 
 
329 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 
341 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.26 
 
 
346 aa  162  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.8 
 
 
342 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 
331 aa  155  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.72 
 
 
359 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0723  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.63 
 
 
334 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
337 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.73 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.54 
 
 
341 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.08 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.88 
 
 
352 aa  145  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  31.38 
 
 
338 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 
340 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
337 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
339 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 
340 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
340 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
327 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  32.63 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.51 
 
 
342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  32.19 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4860  alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
340 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.21 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 
361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
360 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.74 
 
 
338 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.7 
 
 
342 aa  124  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5054  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.59 
 
 
340 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.25 
 
 
342 aa  122  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.25 
 
 
342 aa  122  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5001  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.53 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.773613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4541  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.17 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.42 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
337 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.06 
 
 
324 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10793  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13270)  33.13 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523451  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  29.4 
 
 
358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.36 
 
 
337 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.89 
 
 
326 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
333 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5173  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.01 
 
 
329 aa  109  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1337  oxidoreductase, zinc-binding protein  30.75 
 
 
336 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.79 
 
 
336 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4233  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32 
 
 
326 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0229616  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07636  oxidoreductase (Eurofung)  34.89 
 
 
353 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.499872  normal  0.870175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>