More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3282 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
333 aa  672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  50 
 
 
328 aa  297  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.55 
 
 
333 aa  292  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  48.77 
 
 
320 aa  290  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.4 
 
 
324 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  48.09 
 
 
327 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3311  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.47 
 
 
329 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  42.55 
 
 
332 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.53 
 
 
332 aa  277  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  47.45 
 
 
329 aa  276  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.73 
 
 
329 aa  276  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0935  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.15 
 
 
329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000152642 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.87 
 
 
328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.91 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.79 
 
 
326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 
325 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.24 
 
 
333 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 
333 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.88 
 
 
331 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 
333 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  44.94 
 
 
326 aa  269  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.69 
 
 
334 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13811  oxidoreductase  43.87 
 
 
328 aa  268  7e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.334281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.68 
 
 
335 aa  268  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0180  alcohol dehydrogenase  46.47 
 
 
329 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.089146  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.03 
 
 
334 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2736  alcohol dehydrogenase  45.19 
 
 
328 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00823064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 
334 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.09 
 
 
332 aa  266  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  43.52 
 
 
334 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  44.24 
 
 
389 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  42.24 
 
 
335 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0568  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.54 
 
 
333 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.73 
 
 
322 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  48.01 
 
 
325 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.23 
 
 
323 aa  262  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  43.44 
 
 
336 aa  261  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  42.28 
 
 
328 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.73 
 
 
336 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.64 
 
 
342 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  46.01 
 
 
353 aa  260  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1498  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.23 
 
 
328 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.59 
 
 
332 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.34 
 
 
336 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.44 
 
 
334 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.27 
 
 
332 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 
332 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.84 
 
 
332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 
328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.96 
 
 
332 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 
324 aa  258  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 
334 aa  258  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.41 
 
 
336 aa  258  9e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  43.89 
 
 
328 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1295  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.9 
 
 
360 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0519873  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  41.93 
 
 
338 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1340  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.9 
 
 
338 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00600285  normal  0.0548785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0286  quinone oxidoreductase putative PIG3  44.41 
 
 
316 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0411  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 
329 aa  256  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201425  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.43 
 
 
317 aa  256  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.9 
 
 
339 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.413421  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1833  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.9 
 
 
339 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0409  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.9 
 
 
339 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1286  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.9 
 
 
339 aa  255  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1126  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.9 
 
 
339 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.9 
 
 
360 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2169  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  41.72 
 
 
339 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0111433  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  42.95 
 
 
333 aa  255  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.04 
 
 
326 aa  255  7e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 
339 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.72 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.72 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.05 
 
 
338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2816  alcohol dehydrogenase  42.99 
 
 
353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  43.37 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  43.26 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4983  quinone oxidoreductase putative PIG3  46.48 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.39 
 
 
341 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1696  hypothetical protein  40.75 
 
 
333 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  41.96 
 
 
338 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5173  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.51 
 
 
329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  43.61 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  40.12 
 
 
332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.61 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3672  alcohol dehydrogenase  40.82 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  43.61 
 
 
336 aa  252  8.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2065  putative NADPH quinone oxidoreductase protein  41.52 
 
 
334 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.465224  normal  0.69391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.19 
 
 
332 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1057  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.6 
 
 
339 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287283  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3289  oxidoreductase, zinc-binding  40.94 
 
 
329 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.952299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
327 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
327 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4988  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
327 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3513  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.36 
 
 
332 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1697  hypothetical protein  40.13 
 
 
333 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.8 
 
 
335 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.47 
 
 
343 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0146  hypothetical protein  44.94 
 
 
318 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639279  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.82 
 
 
327 aa  249  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.82 
 
 
327 aa  249  6e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>