More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0935 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0935  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  100 
 
 
329 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000152642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3311  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  97.26 
 
 
329 aa  646    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0180  alcohol dehydrogenase  83.18 
 
 
329 aa  560  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.089146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2736  alcohol dehydrogenase  81.96 
 
 
328 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00823064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  82.01 
 
 
328 aa  551  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1088  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  80.43 
 
 
328 aa  532  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0832  alcohol dehydrogenase  81.4 
 
 
328 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000430219  normal  0.313635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.36 
 
 
328 aa  293  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.81 
 
 
326 aa  288  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  44.51 
 
 
332 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.29 
 
 
326 aa  279  4e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.71 
 
 
324 aa  276  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.9 
 
 
326 aa  276  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.9 
 
 
334 aa  276  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.59 
 
 
327 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.65 
 
 
328 aa  275  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.82 
 
 
324 aa  275  9e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  43.81 
 
 
329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  43.29 
 
 
326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 
325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.29 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  46.01 
 
 
320 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.99 
 
 
334 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0336  quinone oxidoreductase putative PIG3  44.04 
 
 
328 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  0.594671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.21 
 
 
338 aa  268  7e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.21 
 
 
329 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  43.6 
 
 
328 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  46.65 
 
 
353 aa  266  5e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.85 
 
 
324 aa  265  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.59 
 
 
333 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  43.08 
 
 
336 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.08 
 
 
336 aa  262  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.71 
 
 
332 aa  261  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  43.08 
 
 
336 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  42.68 
 
 
389 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.6 
 
 
335 aa  259  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.79 
 
 
335 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.73 
 
 
341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.92 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
333 aa  259  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  42.6 
 
 
338 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  45.15 
 
 
334 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  42.68 
 
 
328 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  43.38 
 
 
324 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  45.14 
 
 
332 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  42.68 
 
 
328 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.55 
 
 
332 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  45.73 
 
 
327 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  44.38 
 
 
332 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.86 
 
 
338 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.79 
 
 
335 aa  255  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.95 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.4 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.45 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  42.07 
 
 
335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2169  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.38 
 
 
339 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0111433  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.83 
 
 
332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.82 
 
 
327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 
339 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  42.07 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.57 
 
 
332 aa  251  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
332 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.42 
 
 
343 aa  251  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13811  oxidoreductase  42.57 
 
 
328 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.334281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.73 
 
 
327 aa  250  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.79 
 
 
338 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.95 
 
 
333 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  43.73 
 
 
336 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 
332 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
334 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  41.69 
 
 
325 aa  249  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  41.16 
 
 
333 aa  248  7e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3217  putative NADPH quinone oxidoreductase  43.99 
 
 
338 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00040728  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.79 
 
 
336 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
332 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  41.82 
 
 
324 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.69 
 
 
332 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3513  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.94 
 
 
332 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.48 
 
 
336 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 
328 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.98 
 
 
333 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4023  alcohol dehydrogenase  41.52 
 
 
345 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.961336  unclonable  0.000000000225765 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0631  quinone oxidoreductase putative PIG3  43.71 
 
 
333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2276  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.08 
 
 
339 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000917722  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2252  alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 
339 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0476734  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1340  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.79 
 
 
338 aa  245  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00600285  normal  0.0548785 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  41.23 
 
 
345 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1640  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 
339 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00037111  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.23 
 
 
345 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3252  alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 
333 aa  245  8e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.08 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  41.23 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0658  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.71 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5580  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.08 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0129924  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  40.55 
 
 
342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  42.44 
 
 
327 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0654  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.4 
 
 
333 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3731  alcohol dehydrogenase  43.4 
 
 
333 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4988  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.44 
 
 
327 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  42.44 
 
 
327 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>