More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0282 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  100 
 
 
317 aa  622  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  62.03 
 
 
324 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  63.46 
 
 
327 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4988  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.46 
 
 
327 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  63.46 
 
 
327 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5615  alcohol dehydrogenase  62.1 
 
 
325 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  60.06 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  59.94 
 
 
324 aa  351  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  62.62 
 
 
343 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  59.35 
 
 
324 aa  345  7e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  59.24 
 
 
325 aa  343  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13811  oxidoreductase  57.23 
 
 
328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.334281 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  56.19 
 
 
328 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  56.27 
 
 
324 aa  332  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  57.28 
 
 
327 aa  333  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  55.02 
 
 
320 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  54.78 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  55.38 
 
 
327 aa  318  7e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0286  quinone oxidoreductase putative PIG3  55.81 
 
 
316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0308  Quinone oxidoreductase putative PIG3  58.31 
 
 
329 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166873  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  55.59 
 
 
324 aa  309  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4322  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.52 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4094  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  57.42 
 
 
325 aa  300  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  60.97 
 
 
325 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4983  quinone oxidoreductase putative PIG3  58.6 
 
 
325 aa  295  9e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0146  hypothetical protein  55.34 
 
 
318 aa  291  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639279  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  53.21 
 
 
353 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.13 
 
 
333 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  48.36 
 
 
325 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  47.84 
 
 
332 aa  275  7e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.7 
 
 
327 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.96 
 
 
323 aa  271  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.33 
 
 
334 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04350  quinone reductase  46.03 
 
 
325 aa  266  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.35 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  48.18 
 
 
328 aa  266  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  48.4 
 
 
332 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.22 
 
 
332 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01790  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  53.75 
 
 
332 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3513  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.92 
 
 
332 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  48.39 
 
 
341 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.53 
 
 
334 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  46.53 
 
 
328 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.45 
 
 
326 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.04 
 
 
335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  50.65 
 
 
333 aa  258  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  46.53 
 
 
328 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.75 
 
 
338 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1025  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  49.52 
 
 
339 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0042079  normal  0.442339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 
333 aa  255  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.06 
 
 
335 aa  255  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.72 
 
 
331 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  46.2 
 
 
338 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.86 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.7 
 
 
334 aa  252  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.54 
 
 
336 aa  252  6e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  48.54 
 
 
328 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  47.57 
 
 
328 aa  252  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.67 
 
 
332 aa  252  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  47.91 
 
 
339 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2169  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  47.91 
 
 
339 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0111433  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.75 
 
 
335 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.52 
 
 
332 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3259  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.29 
 
 
340 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.86 
 
 
336 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.54 
 
 
328 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.67 
 
 
342 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3311  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.34 
 
 
329 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.7 
 
 
326 aa  249  6e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.7 
 
 
334 aa  249  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1340  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.5 
 
 
338 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00600285  normal  0.0548785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0913  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  47.6 
 
 
328 aa  249  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0131994 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  45.42 
 
 
336 aa  248  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.42 
 
 
336 aa  248  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.32 
 
 
334 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3217  putative NADPH quinone oxidoreductase  46.52 
 
 
338 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00040728  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.6 
 
 
338 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  45.1 
 
 
332 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.51 
 
 
322 aa  247  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  45.42 
 
 
336 aa  247  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0397  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  50.79 
 
 
327 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  43.59 
 
 
336 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3317  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.83 
 
 
334 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0270  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.03 
 
 
320 aa  246  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.974154  normal  0.251208 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  45.43 
 
 
333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.6 
 
 
360 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1286  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.6 
 
 
339 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1833  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.6 
 
 
339 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.6 
 
 
339 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.413421  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1126  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.6 
 
 
339 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0409  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.6 
 
 
339 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0935  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.08 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000152642 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03640  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.08 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.325651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06850  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.28 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.164125  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0568  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.93 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1057  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.96 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  46.45 
 
 
389 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  46.45 
 
 
334 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.11 
 
 
334 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21890  putative oxidoreductase  45.22 
 
 
320 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000278447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>