More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21890 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_21890  putative oxidoreductase  100 
 
 
320 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000278447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1869  putative oxidoreductase  97.5 
 
 
320 aa  613  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35160  Zinc-containing alcohol dehydrogenase-like protein  78.06 
 
 
320 aa  498  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1680  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  75.94 
 
 
320 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105299  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1322  alcohol dehydrogenase  76.18 
 
 
320 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0680057  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3884  oxidoreductase, zinc-binding protein  73.04 
 
 
320 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1600  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  72.73 
 
 
320 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0398631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1720  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  70.22 
 
 
320 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161513  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3999  quinone oxidoreductase putative, PIG3  70.22 
 
 
320 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0207261  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1312  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  70.22 
 
 
320 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.303987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1269  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  70 
 
 
320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.731521  normal  0.0486073 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3042  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.22 
 
 
323 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.66 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.4 
 
 
326 aa  259  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.98 
 
 
324 aa  259  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  46.37 
 
 
324 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.31 
 
 
338 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  44.33 
 
 
325 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  46.2 
 
 
320 aa  249  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.79 
 
 
324 aa  248  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.54 
 
 
322 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  43.85 
 
 
328 aa  246  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
327 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
325 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
327 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4988  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
327 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.95 
 
 
323 aa  245  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.74 
 
 
334 aa  245  8e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.25 
 
 
324 aa  245  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6553  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.04 
 
 
320 aa  245  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5615  alcohol dehydrogenase  46.13 
 
 
325 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.22 
 
 
317 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13811  oxidoreductase  42.86 
 
 
328 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.334281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 
327 aa  240  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.37 
 
 
329 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 
327 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  45.31 
 
 
328 aa  236  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02390  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.14 
 
 
325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.803043  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  45.63 
 
 
353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.53 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3317  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.64 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.01 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.85 
 
 
343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.67 
 
 
335 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.9 
 
 
328 aa  230  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0391  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.19 
 
 
335 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.57 
 
 
332 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  43.89 
 
 
335 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.49 
 
 
327 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.76 
 
 
335 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0308  Quinone oxidoreductase putative PIG3  45.42 
 
 
329 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166873  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  41.31 
 
 
332 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  42.57 
 
 
328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.86 
 
 
342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  42.72 
 
 
327 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2167  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.41 
 
 
327 aa  225  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.59 
 
 
345 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  44.59 
 
 
345 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
328 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3731  alcohol dehydrogenase  43.23 
 
 
333 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  43.41 
 
 
326 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0658  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.62 
 
 
333 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0631  quinone oxidoreductase putative PIG3  43.23 
 
 
333 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0146  hypothetical protein  46.2 
 
 
318 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639279  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  43.93 
 
 
341 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0411  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.84 
 
 
329 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0654  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.23 
 
 
333 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 
334 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04350  quinone reductase  43.75 
 
 
325 aa  223  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  42.24 
 
 
333 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4094  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.23 
 
 
325 aa  222  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.97 
 
 
356 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3311  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  40.25 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.44 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.12 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  43.09 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.23 
 
 
336 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  43.23 
 
 
336 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  43.09 
 
 
328 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0935  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  39.94 
 
 
329 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000152642 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0533  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.26 
 
 
333 aa  219  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0360473 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  43.23 
 
 
336 aa  219  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  39.23 
 
 
332 aa  218  8.999999999999998e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  41.4 
 
 
329 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.71 
 
 
338 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  41.91 
 
 
334 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3217  putative NADPH quinone oxidoreductase  41.19 
 
 
338 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00040728  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0286  quinone oxidoreductase putative PIG3  41.59 
 
 
316 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  40.58 
 
 
332 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.91 
 
 
326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.91 
 
 
334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.89 
 
 
332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  42.47 
 
 
332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  40.26 
 
 
332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4023  alcohol dehydrogenase  40.95 
 
 
345 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.961336  unclonable  0.000000000225765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 
333 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.91 
 
 
332 aa  216  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.23 
 
 
334 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.48 
 
 
334 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>