More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1680 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1680  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
320 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105299  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3884  oxidoreductase, zinc-binding protein  80.56 
 
 
320 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1600  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  80.56 
 
 
320 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0398631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1322  alcohol dehydrogenase  77.43 
 
 
320 aa  521  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0680057  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35160  Zinc-containing alcohol dehydrogenase-like protein  77.43 
 
 
320 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1869  putative oxidoreductase  76.56 
 
 
320 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21890  putative oxidoreductase  75.94 
 
 
320 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000278447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1720  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  73.35 
 
 
320 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161513  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3999  quinone oxidoreductase putative, PIG3  73.35 
 
 
320 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0207261  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1312  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  73.04 
 
 
320 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.303987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1269  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  72.19 
 
 
320 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.731521  normal  0.0486073 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3042  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.9 
 
 
323 aa  299  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  49.35 
 
 
320 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  46.71 
 
 
332 aa  268  8e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.1 
 
 
324 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  44.26 
 
 
325 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.39 
 
 
327 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.95 
 
 
324 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.93 
 
 
334 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.89 
 
 
323 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  47.37 
 
 
338 aa  259  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  45.9 
 
 
325 aa  259  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.66 
 
 
331 aa  258  6e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  45.89 
 
 
328 aa  258  7e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  47 
 
 
324 aa  258  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  46.96 
 
 
327 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  46.96 
 
 
327 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4988  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.96 
 
 
327 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  47.21 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6553  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.28 
 
 
320 aa  252  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.43 
 
 
326 aa  251  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  45.03 
 
 
333 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  46 
 
 
328 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.34 
 
 
334 aa  249  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  48.39 
 
 
353 aa  249  5e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.06 
 
 
324 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5615  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
325 aa  248  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.77 
 
 
336 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  45.67 
 
 
328 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  44.77 
 
 
336 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  44.77 
 
 
336 aa  247  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.25 
 
 
335 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  46.77 
 
 
328 aa  245  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13811  oxidoreductase  42.22 
 
 
328 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.334281 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  45.93 
 
 
327 aa  245  9e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4094  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.22 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0308  Quinone oxidoreductase putative PIG3  47.87 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166873  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.02 
 
 
329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3317  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.03 
 
 
334 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.71 
 
 
343 aa  242  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.87 
 
 
338 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.52 
 
 
333 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.2 
 
 
317 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  44.81 
 
 
341 aa  238  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.31 
 
 
338 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.95 
 
 
334 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2167  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.48 
 
 
327 aa  236  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  44.52 
 
 
334 aa  235  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3217  putative NADPH quinone oxidoreductase  43.07 
 
 
338 aa  235  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00040728  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1340  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.07 
 
 
338 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00600285  normal  0.0548785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.04 
 
 
334 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  44.22 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.63 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.16 
 
 
332 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  41.45 
 
 
332 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0391  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.71 
 
 
335 aa  232  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0146  hypothetical protein  48.53 
 
 
318 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639279  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.85 
 
 
326 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  43.04 
 
 
336 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.85 
 
 
334 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 
328 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.81 
 
 
342 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02390  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  41.22 
 
 
325 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.803043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.59 
 
 
335 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  43.71 
 
 
345 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4023  alcohol dehydrogenase  42.09 
 
 
345 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.961336  unclonable  0.000000000225765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.9 
 
 
333 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.71 
 
 
345 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.81 
 
 
328 aa  229  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4281  alcohol dehydrogenase  43.85 
 
 
344 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.672706  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.76 
 
 
369 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04350  quinone reductase  44.08 
 
 
325 aa  229  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  42.86 
 
 
334 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.34 
 
 
334 aa  228  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2169  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  42.09 
 
 
339 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0111433  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  42.09 
 
 
339 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.37 
 
 
332 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.89 
 
 
356 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.8 
 
 
332 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.83 
 
 
332 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
332 aa  226  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1025  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  42.39 
 
 
339 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0042079  normal  0.442339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0935  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.1 
 
 
329 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000152642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  40.85 
 
 
332 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2252  alcohol dehydrogenase  42.39 
 
 
339 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0476734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1640  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.39 
 
 
339 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00037111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2276  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  42.39 
 
 
339 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000917722  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  41.37 
 
 
332 aa  225  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  44.01 
 
 
334 aa  225  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>