More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3999 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1720  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  99.69 
 
 
320 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161513  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3999  quinone oxidoreductase putative, PIG3  100 
 
 
320 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0207261  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1312  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  97.19 
 
 
320 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.303987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1269  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  93.42 
 
 
320 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.731521  normal  0.0486073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1680  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  73.35 
 
 
320 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105299  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3884  oxidoreductase, zinc-binding protein  71.88 
 
 
320 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1600  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  72.19 
 
 
320 aa  471  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0398631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1322  alcohol dehydrogenase  71.88 
 
 
320 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0680057  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35160  Zinc-containing alcohol dehydrogenase-like protein  69.69 
 
 
320 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1869  putative oxidoreductase  71.16 
 
 
320 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21890  putative oxidoreductase  70.22 
 
 
320 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000278447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3042  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.59 
 
 
323 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  48.66 
 
 
328 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.39 
 
 
326 aa  257  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  48.32 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  47 
 
 
333 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.07 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.1 
 
 
324 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  46.86 
 
 
320 aa  249  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45 
 
 
327 aa  248  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.31 
 
 
324 aa  248  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  44.87 
 
 
328 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.38 
 
 
324 aa  245  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.83 
 
 
331 aa  245  8e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  45.81 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  45.81 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4988  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.81 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  46.1 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  43.67 
 
 
325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.63 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  46.89 
 
 
322 aa  243  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.16 
 
 
338 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  43.27 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  43.85 
 
 
324 aa  238  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.69 
 
 
334 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.36 
 
 
335 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  44.74 
 
 
335 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3317  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.17 
 
 
334 aa  235  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.78 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6553  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.38 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  43.09 
 
 
336 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.09 
 
 
336 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  43.09 
 
 
336 aa  232  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5615  alcohol dehydrogenase  45.15 
 
 
325 aa  231  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0411  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.29 
 
 
329 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201425  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  44.74 
 
 
341 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.56 
 
 
326 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.9 
 
 
342 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.56 
 
 
334 aa  229  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 
329 aa  229  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.27 
 
 
329 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.13 
 
 
328 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  46.13 
 
 
333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.39 
 
 
333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.41 
 
 
335 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  42.12 
 
 
327 aa  225  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  43.23 
 
 
332 aa  225  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  41.78 
 
 
332 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.3 
 
 
343 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.53 
 
 
317 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.81 
 
 
333 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.21 
 
 
327 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.93 
 
 
356 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 
327 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  43.41 
 
 
334 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 
332 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  45.13 
 
 
353 aa  222  8e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2816  alcohol dehydrogenase  45.66 
 
 
353 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  43.33 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.5 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  44.19 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.69 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.12 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  43.69 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.05 
 
 
369 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.87 
 
 
332 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  43.62 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  40.26 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.58 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  41.75 
 
 
334 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3513  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.4 
 
 
332 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13811  oxidoreductase  40.89 
 
 
328 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.334281 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2065  putative NADPH quinone oxidoreductase protein  44.97 
 
 
334 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.465224  normal  0.69391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0533  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.81 
 
 
333 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0360473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  42.14 
 
 
333 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2167  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.87 
 
 
327 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  42.57 
 
 
335 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0391  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.29 
 
 
335 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  44.37 
 
 
334 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.09 
 
 
345 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49690  oxidoreductase  42.35 
 
 
328 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  43.09 
 
 
345 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.03 
 
 
334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04350  quinone reductase  43.93 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3311  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  39.81 
 
 
329 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.75 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  41.94 
 
 
336 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2276  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  41.79 
 
 
339 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000917722  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1640  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.79 
 
 
339 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00037111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2252  alcohol dehydrogenase  41.79 
 
 
339 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0476734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>